Phénotype moléculaire et génotype.
Dans les cellules XP, une des premières étapes de la réparation par excision-resynthèse (NER) est déficiente. La plupart des gènes de réparation impliqués ont été identifiés :
La reconnaissance des dimères fait intervenir les produits des génes ERCC1, XPA et XPF qui interagissent avec le facteur de transcription TFIIH (produits des gènes de réparation XPB et XPD).
L'excision des dimères est réalisée par les produits des gènes ERCC1 et XPG. L'opération est achevée par l'action de la polymérase et de la ligase.
La protéine de réparation résultant de l'expression du gène XPA comporte 273 acides aminés. C'est une protéine en "doigts de Zinc".
Le gène XPA (25 Kb) est localisé sur le chromosome 9 et comporte 6 exons.
Des mutations affectant ces exons entrainent une altération totale ou partielle de la fonction réparatrice.
 nbsp;les méthodes ont reposé le plus souvent sur l'introduction dans des cellules sensibles aux UV de fragments d'ADN restaurant chez ces cellules un comportement normal. Le clonage et séquençage de ces gènes ont permis de connaitre la séquence en acides aminés des protéines impliquées et ainsi de déduire la fonction de ces enzymes.
Au moins huit gènes seraient impliqués dans le syndrome XP.
Quelques mutations retenues
Des substitutions
Noms des allèles dans la banque de données | Nature et position de la mutation | Conséquences phénotypiques | Incidence sur la protéine |
xpa_norm | pas d'hypersensibilité aux UV (réparation normale) | ||
xpa_mut1 | G -> A 216 | pas d'hypersensibilité aux UV (réparation normale) | aucune |
xpa_mut2 | G -> C 381 | faible sensibilité (légère altération de la fonction réparatrice) | Asp->His 127 |
xpa_mut3 | C -> T 457 | forte sensibilité aux UV (pas de fonction réparatrice) | protéine écourtée |
xpa_mut4 | A -> G 557 | sensibilité intermédiaire (diminution de la fonction réparatrice) | His -> Arg 186 |
xpa_mut5 | T -> A 174 | forte sensibilité aux UV (pas de fonction réparatrice) | protéine écourtée |
xpa_mut6 | C -> T 508 | forte sensibilité aux UV (pas de fonction réparatrice) | protéine écourtée |
xpa_mut7 | T -> G 139 T -> A 148 T -> G 202 T -> A 211 | très forte sensibilité (pas de fonction réparatrice) | Cys -> Gly 47 Cys -> Ser 50 Cys -> Gly 68 Cys -> Ser 71 |
Des délétions
Noms des allèles dans la banque de données | Nature et importance de la mutation | Conséquences phénotypiques | Incidence sur la protéine |
xpa_mut8 | delétion de A 59 à A 79 | forte sensibilité aux UV (pas de fonction réparatrice) | séquence modifiée protéine écourtée |
xpa_mut9 | délétion C 200 | forte sensibilité aux UV (pas de fonction réparatrice) | séquence modifiée protéine écourtée |
xpa_mu10 | délétion de 172 à 177 (TATCT) | forte sensibilité aux UV (pas de fonction réparatrice) | séquence modifiée protéine écourtée |
Conclusion :