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Phénotype moléculaire et génotype.

Par sbergeot — Dernière modification 08/04/2019 12:10
complété par le travail de Samuel Jean

Dans les cellules XP, une des premières étapes de la réparation par excision-resynthèse (NER) est déficiente. La plupart des gènes de réparation impliqués  ont été identifiés :

La reconnaissance des dimères fait intervenir les produits des génes ERCC1, XPA et XPF qui interagissent avec le facteur de transcription TFIIH (produits des gènes de réparation XPB et XPD).

L'excision des dimères est réalisée par les produits des gènes ERCC1 et XPG. L'opération est achevée par l'action de la polymérase et de la ligase.

La protéine de réparation résultant de l'expression du gène XPA comporte 273 acides aminés. C'est une protéine en "doigts de Zinc".

Le gène XPA (25 Kb) est localisé sur le chromosome 9 et comporte 6 exons.

Des mutations affectant ces exons entrainent une altération totale ou partielle de la fonction réparatrice.

 nbsp;les méthodes ont reposé le plus souvent sur l'introduction dans des cellules sensibles aux UV de fragments d'ADN restaurant chez ces cellules un comportement normal. Le clonage et séquençage de ces gènes ont permis de connaitre la séquence en acides aminés des protéines impliquées et ainsi de déduire la fonction de ces enzymes.
Au moins huit gènes seraient impliqués dans le syndrome XP.

Quelques mutations retenues

Des substitutions
 

Noms des allèles dans la banque de données Nature et position de la mutation Conséquences phénotypiques Incidence sur la protéine
xpa_norm   pas d'hypersensibilité aux UV (réparation normale)  
xpa_mut1 G -> A 216 pas d'hypersensibilité aux UV (réparation normale) aucune
xpa_mut2 G -> C 381 faible sensibilité (légère altération de la fonction réparatrice) Asp->His 127
xpa_mut3  C -> T 457 forte sensibilité aux UV (pas de fonction réparatrice) protéine écourtée
xpa_mut4 A -> G 557 sensibilité intermédiaire (diminution de la fonction réparatrice) His -> Arg 186
xpa_mut5 T -> A 174 forte sensibilité aux UV (pas de fonction réparatrice) protéine écourtée
xpa_mut6 C -> T 508 forte sensibilité aux UV (pas de fonction réparatrice) protéine écourtée
xpa_mut7 T -> G 139 
T -> A 148 
T -> G 202  T -> A 211
très forte sensibilité (pas de fonction réparatrice) Cys -> Gly 47
Cys -> Ser 50
Cys -> Gly 68 Cys -> Ser 71

 

 Des délétions
 

Noms des allèles dans la banque de données Nature et importance de la mutation Conséquences phénotypiques Incidence sur la protéine
xpa_mut8 delétion de A 59 à A 79 forte sensibilité aux UV (pas de fonction réparatrice) séquence modifiée protéine écourtée
xpa_mut9 délétion C 200 forte sensibilité aux UV (pas de fonction réparatrice) séquence modifiée protéine écourtée
xpa_mu10 délétion de 172 à 177 (TATCT) forte sensibilité aux UV (pas de fonction réparatrice) séquence modifiée protéine écourtée

 

 Conclusion :

Schéma bilan XP