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Comment les deux brins sont-ils solidarisés ?

  Travail à faire avec RASTOP

L’exploration précédente a révélé que :

  •  les bases azotées occupent l’espace central de la molécule,
  • deux bases en vis-à-vis et appartenant à chaque brin sont coplanaires,
  • les bases appariées ne sont pas quelconques : il y a des paires de bases complémentaires ATet CG.


    L’objectif est de préciser la notion de complémentarité des bases et de découvrir les modalités de leur appariement.

ObjectifsActions

              Vérifier la complémentarité des nucléotides

adn_nuc_color1.gif

  • Editer une commande et enregistrer un script

              - Sélectionner Editer puis Commande
              - Ecrire:
                  select*a
                  color red
                  select* b
                  color blue
                  select*c
                  color green
                  select*g
                  color yellow
                  select all


editer_script2.gif


           - Eventuellement, copier la commande dans le presse papier et la coller dans l'éditeur de notes "BlocNotes" : sauvegarder le script sous nucleotide.scr

     - Valider la commande : cliquer sur OK

     - Repérer les nucléotides appariés : nom et numéro dans la séquence (exemple : a17 et t8)

Isoler des paires de nucléotides et voir comment elles sont associées.

a17t8._3.gif

 

  • Sélectionner tout selection_all4.jpe
  • Afficher en boules et bâtonnets render_ballstick5.jpe
  • Colorer par type d'atomes: "-" de la palette des couleurs
    cpk6.gif
  • Sélectionner la paire "a17 et t8" pour cela :

              -Activer l'icône "expression" icone_expression7.jpg
              -Ecrire a17,t8
expression_a17t8_8.gif

  • Isoler la paire "a17 et t8" pour cela :

              - A partir du menu, choisir Editer puis Restreindre
              - Etudier la paire A17T8

  • Pour étudier une autre paire :

              -Sélectionner tout  selectionall8
              -Afficher en boules et bâtonnets render_ballstick5.jpe
              -Reprendre la démarche sur une autre paire.