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Sirius

Par salame — Dernière modification 29/09/2017 13:36

Sirius.jpg

 

Sirius est un logiciel de visualisation spatiale des molécules réalisé par le San Diego Super Computer (Université de Californie à San Diego).

La version est en anglais et à télécharger ici

Présentation rapide des spécificités de Sirius

 

Ecran d'accueil

Remarquer la possibilité d'affichage simultané de la séquence en 3D, de sa structure et de sa composition atomique. La barre des icônes est  paramétrable (nature des icône et emplacement de la barre dans la fenêtre, ici calée en haut).

Sirius-Display.jpg

 Principales caractéristiques du logiciel

Par rapport à Rasmol et Rastop, Sirius présente plusieurs innovations :

  • Language de commande et scripts compatibles avec RasMol (et RasTop)
  • Accès direct aux banques de données en ligne PDB, InterPro et Uniprot
  • Alignement des structures protéiques relatives aux molécules affichées
  • Editeur évolué des alignements de séquences
  • Modélisation de structures protéiques à partir de fragments et de peptides
  • Ajout des hydrogènes, détection des liaisons hydrogène et des conflits stériques
  • Affichage des éléments d'une structure couplé avec la visualisation 3D
  • Sélection graphique des élèments couplée avec le choix des modes de  visualisation et de la coloration
  • Manipulation indépendante des différentes structures  affichées