Enseigner les Sciences de la nature

logo ensl   Logo du ministère de l'éducation
logo CIRI logo Immuniser Lyon
logo LBMC logo Musée Mérieux
Logo Inserm igfl igfl logo CREATIS
Logo du Museum national des histoires naturelles
Logo du musée de Confluences
logo geo 3d
Logo de Lyon 1 logo lgltpe 
Logo du Museum national des histoires naturelles
Logo du musée de Confluences
logo LBMC
logo LBMC
logos composé logo COP In My City logo Investissement d'avenirLogo du musée de Confluences
logo Météo France Logo du musée de Confluences
logo EVSlogo Grand Lyon

Sirius

Sirius.jpg

 

Sirius est un logiciel de visualisation spatiale des molécules réalisé par le San Diego Super Computer (Université de Californie à San Diego).

La version est en anglais et à télécharger ici

Présentation rapide des spécificités de Sirius

 

Ecran d'accueil

Remarquer la possibilité d'affichage simultané de la séquence en 3D, de sa structure et de sa composition atomique. La barre des icônes est  paramétrable (nature des icône et emplacement de la barre dans la fenêtre, ici calée en haut).

Sirius-Display.jpg

 Principales caractéristiques du logiciel

Par rapport à Rasmol et Rastop, Sirius présente plusieurs innovations :

  • Language de commande et scripts compatibles avec RasMol (et RasTop)
  • Accès direct aux banques de données en ligne PDB, InterPro et Uniprot
  • Alignement des structures protéiques relatives aux molécules affichées
  • Editeur évolué des alignements de séquences
  • Modélisation de structures protéiques à partir de fragments et de peptides
  • Ajout des hydrogènes, détection des liaisons hydrogène et des conflits stériques
  • Affichage des éléments d'une structure couplé avec la visualisation 3D
  • Sélection graphique des élèments couplée avec le choix des modes de  visualisation et de la coloration
  • Manipulation indépendante des différentes structures  affichées