Fichiers .edi pour Anagène
Par Naoum Salamé
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Dernière modification
19/09/2017 09:37
Produire des fichiers pour Anagène
1 - Récupérer une séquences dans NCBI
- Choisir un fichier de séquence
- Cliquer sur FASTA. Résultat :
- Copier le texte de la séquence (en majuscules à partir de >). Eventuellement, ne garder que le nom de l'organisme.
- Coller dans Notepad ou Wordpad
- Enregistrer au nom et à l'endroit souhaités (Par défaut, Notepad et Wordpad enregistrent au format texte, avec extension .txt. Avec l'explorateur de Windows, changer l'extension en .pro ou .adn suivant la nature de la séquence).
NB : De la même manière, on peut extraire une séquence à partir de n'importe quel fichier texte.
2 - Ouvrir la séquence avec Anagène (sélection de plusieurs séquences possible)
- Lancer Anagène
- Fichier, Ouvrir
- Cliquer sur le nom de la séquence enregistrée.
- Anagène reconnaît le format texte et propose de l'ouvrir en tant que séquence. Valider pour chaque séquence.
- La séquence est affichée dans Anagène.
3 - Produire un fichier .edi
- Dans Anagène, Fichier, Enregistrer
- Choisir "La fenêtre "Affichage des séquences", puis "Sur disque ou disquette" et OK
- Enregistrer à l'endroit voulu en remplaçant le nom par défaut (Edition des séquences.edi) par le nom souhaité (garder l'extension .edi)
4 - Produire un thème d'étude
- Enregistrer "Toutes les fenêtres" ouvertes dans les thèmes d'étude (extension .thm). Ne pas supprimer les différents fichiers créés associés à chaque thème.