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Approche anatomique, approche moléculaire

Continuité entre approches anatomique et moléculaire des phylogénies

 

L'utilisation des données moléculaires devrait permettre de conforter les phylogénies obtenues avec les données anatomiques, d'en affiner certaines, et d'aborder les relations de parenté dans les cas où les données anatomiques ne sont pas disponibles ou adaptées.

 

Un texte de cadrage présentera quelques propositions d'intégration pédagogique.

 


1 - Une nouvelle collection "Unité du vivant Lycée" adaptée au lycée est proposée (en plus des collections vertébrés actuels et fossiles du collège et de la collection Vertébrés seconde). Cette collection est calée sur la liste des organismes dont on dispose des séquences de la molécule "CDC2" (Contrôle du cycle de la division cellulaire). Le gène CDC2 code pour une protéine-kinase qui exerce un contrôle sur deux points crutiaux du cycle cellulaire : l'entrée en phase S, et l'entrée en mitose.

 

A l'échelle du vivant ou presque (nous ne disposons malheureusement pas du CDC2 d'une Bactérie), il est donc possible d'étudier les relations de parenté sur des bases anatomiques et moléculaires avec les mêmes organismes.

 

Unité du vivant - Données anatomique

 

Arbre-Unité du vivant.jpg

Séquences CDC2

 

Arbre-Unité du vivant-cdc2-adn.jpg



2 - De nouveaux jeux de données moléculaires sont également fournis pour l'étude des phylogénies entre Primates (Molécules retenues : ADN mitochondrial de la cytochrome oxidase subunité 1 (COI utilisée pour le barcoding) ; Protéine de la cytochrome C oxydase 2 (COX2) ; Chaîne de la globine bêta (HBB).

 

Primates – Données anatomiques

 

Arbre-Primates.jpg

 

Séquences globine bêta

 

Arbre-Primates-HBB.jpg

 

Séquences opsine-bleu

 

Arbre-Primates-Opsine-Bleu.jpg

 

Séquences COX2

 

Arbre-Primates-COX2.jpg

 

Séquences COI primates

 

Arbre-Primates-COI.jpg

 

Séquences COI Hominoïdes

 

Arbre-Hominoides-COI.jpg



3 - Pour les Vertébrés,les fichiers de séquences sont calés sur la liste des taxons de la collection Vertébrés seconde. Molécules retenues : HBA-Vertebres ; HBB-Vertebres ; ARN 12S-Vertebres ; Cytochrome B oxydase (Cytb-Vertebres). Deux fichiers plus fournis  en staxons (ARN 12S-Vertebres-Etendu ; HBA-Verrtebres-Etendu ;  HBB-Vertebres-Etendu) permettent d'effectuer d'autres échantillonnages.

 

Vertébrés seconde - – Données anatomiques

 

Arbre-Vertébrés.jpg

 

Séquences globine alpha

 

Arbre-Vertébrés-HBA.jpg

 

Séquences globine bêta

 

Arbre-Vertébrés-HBB.jpg

 

 Séquences ARN 12S

 

Arbre-Vertébrés-12S.jpg

 

Séquences cytochrome B oxydase

 

Arbre-Vertébrés-cytb.jpg