Aller au contenu. | Aller à la navigation

Outils personnels

Plateforme - ACCES
Navigation

Foire aux questions

Par s.beaudin — Dernière modification 16/02/2024 15:12
Contributeurs : j.cartier, p.cosentino
Des questions fréquemment posées sur le Logiciel EduAnat2, sa banque AnaPéda et des éléments de réponse

Auteur : S.Beaudin

 

Les aspects techniques du logiciel
Questions Réponses
Peut-on comparer plus de deux images?

Non, le logiciel permet de comparer au maximum deux images différentes, dans les trois plans de coupe.

L'application peut-elle fonctionner sur tablette android?

Oui depuis Avril 2020, pendant le confinement, afin d'assurer au mieux la continuité pédagogique.

https://acces.ens-lyon.fr/logiciels/EduAnat2Online/

Cette version fonctionne à partir de n’importe quel système d’exploitation (y compris sur les tablettes fournies par la région) permet d’accéder à l’intégralité de la banque AnaPeda, avec les mêmes fonctionnalités que le logiciel EduAnat2.

Il permet également de créer des “liens directs” (liens de partage) vers des images anatomiques (et/ou fonctionnelles), en cliquant sur le bouton “Partager via un lien”.

En fournissant ce lien à l’élève, ce dernier accédera directement à l’image sur laquelle son professeur souhaite le faire travailler.

Exemple de lien direct :

https://acces.ens-lyon.fr/logiciels/EduAnat2Online/?fichiers=IRMsujet13141BisyllabeVersusSilence.anat.nii.gz,IRMsujet13141BisyllabeVersusSilence.fonc.nii.gz

Peut-on utiliser EduAnat2 en réseau sans l'installer sur chaque poste ?

Oui, il suffit de copier le dossier dézippé dans un emplacement réseau (dossier de la classe par exemple).

De plus, le logiciel peut fonctionner en version portable sur clé USB.

Pourra-t-on utiliser ce nouveau logiciel aux ECE (juin 2019)?

Tout dépend du type de fichier à ouvrir :

- Pour les images de l'ancienne banque au format analyze, converties au format nifti compressé dans la nouvelle banque, on pourra utiliser aussi bien EduAnatomist qu'EduAnat2

- Pour les nouvelles images présentes uniquement dans la nouvelle banque,  compte tenu du nouveau format seul EduAnat2 pourra être utilisé.

 

 

Les aspects techniques de la banque
Questions Réponses
J'ai du mal à télécharger la banque AnaPéda.zip Il n'y a pas de problème de téléchargement, mais dans certains cas il peut se produire un problème de décompression de la banque.
J'ai du mal à décompresser AnaPéda.zip sous windows. Un message d'erreur "archive corrompue" apparait.

La structure de la banque engendre des chemins très longs, pouvant, dans certaines configurations, dépasser le maximum de caractères autorisés par Windows.

Exemple de chemin qu'on peut obtenir :

...\AnaPeda\1BanqueNeuroPeda\13ImagerieFonctionnelle\132FonctionsCognitives\1325ReconnaissanceVisuelleMots\IRMsujet13251_Rvwfa.fonc.nii.gz

Soit 181 caractères. C'est ENORME. Mais on est encore en dessous des 260 caractères autorisés par Windows.

Si l'utilisateur a un nom a rallonge, ou si son dossier temporaire (là où l'archive va dans un premier temps être temporairement copiée) est situé à un emplacement dont le chemin est déjà long, des problèmes peuvent survenir.

L'utilisation d'un autre dézippeur que celui de Windows, 7Zip par exemple (gratuit  et opensource), peut résoudre le problème car il n'utilisera pas forcément le même chemin temporaire que Windows.

Mais malgré tout des problèmes peuvent subsister dans certaines configurations.

J'ai du mal à décompresser AnaPéda.zip sous Mac avec l'utilitaire par défaut qui fait remonter un message d'erreur "archive corrompue". Il semblerait que l'utilisation d'un autre décompresseur "The Unarchiver" fonctionne.
J'ai du mal à décompresser AnaPéda.zip sous Linux mint 19 (message d'erreur "archive corrompue"). Il semblerait que l'utilisation d'un autre décompresseur "Archive Manager" sous linux mint 19.
Je n'ai pas bien compris comment et pourquoi renommer les fichiers d'AnaPéda...

Renommer les images de la banque AnaPéda  : un préalable à toute utilisation :

Lorsqu’on renomme une image anatomique il faut attribuer exactement le même nom au fichier codant le volume 3D. Dans le cas contraire le volume tridimensionnel ne s’affichera pas, sans pour autant empêcher l’observation des trois plans de coupes. Le logiciel EduAnat2 supporte les accents.

Lire l'article complet en cliquant ici 

A propos des réglages des seuils : où les trouver?

Les seuils ne sont présents que pour les IRM fonctionnelles.

Ils sont disponibles sous la fore d'un fichier .pdf à l'adresse ci-après pour la nouvelle banque

https://acces.ens-lyon.fr/acces/thematiques/neurosciences/outils-numeriques/eduanat2-et-anapeda/informations-sur-les-images-anapeda

Pour les images de l'ancienne banque, ils sont disponibles ici, dans un document interactif qui permet de surcroit d'accéder aux fiches pédagogiques enseignant contenant entre autre des informations sur la publication originale, les protocoles d’acquisition, le paradigme de construction des images, les caractéristiques techniques de l’imageur …

https://acces.ens-lyon.fr/acces/thematiques/neurosciences/outils-numeriques/eduanatomist-neuropeda/informations-sur-les-images

Remarque : vous pouvez utiliser le document de l'ancienne banque pour accéder aux fiches pédagogiques enseignant.

Peut-on charger uniquement les fichiers utiles à l'activité proposée dans un espace numérique de travail destiné aux élèves puis les ouvrir avec Eduanat2?

En préalable, l'enseignant doit télécharger la totalité de la banque qui se présente sous la forme d'un seul ZIP.

Ensuite, à lui de déposer sur un dossier à destination des élèves, les seuls fichiers dont il a besoin pour sa séquence pédagogique, en prenant soin de les renommer simplement, afin de s'affranchir de la complexité des noms de fichiers qui n'a pas vraiment de sens pour l'élève et peut constituer un obstacle didactique.