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Quelques données moléculaires sur les protéines L1 du HPV


Modèle tridimensionnel de la protéine L1 du papillomavirus de type 16


Page donnant diverses informations et notamment la structure de la VLP (Virus Like Particle) faite avec cette protéine L1 et utilisée comma antigène pour vacciner
http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/cgi-bin/pdbsum/GetPage.pl?pdbcode=1dzl

Le fichier numérique représentant cette protéine L1 du virus HPV 16, observable avec le logiciel RASTOP (ou DS Vizualiser) s’appelle « 1dzl.pdb ».

On le télécharge à partir de la banque Protein Data Bank, en cliquant sur le lien PDB (RCSB, en haut dans la colonne Quick Links de droite), une nouvelle page s’ouvre alors; on clique à côté de son nom (sur le petit logo rectangulaire avec une flèche descendante) pour le télécharger.

 

Séquences de la protéine L1 des deux sous-types de virus HPV 16 et HPV 18

  • Séquence de la protéine L1 de HPV 18 : 39 acides aminés
DQLTICASTP TPEPXQYDAT XFXHLCRHXE EYDLTDYSF
  • Séquence de la protéine L1 de HPV 16 : 47 acides aminés
FVTVVDTTRS TNMSLCAAIS TSEPTYKNTN FKEYLRHGEE YDLQFIF

 

Correspondance avec les noms des acides aminés: codes des acides aminés