SEQAID II - Minidoc

Répertoires des données

Code des extensions des fichiers de données
 
----.VUE 
Fichier à afficher mais à ne pas charger (visualisation des deux brins de l'ADN) 
----.ADN
Gène complet, brin non transcrit; avec introns et exons
---ARNM.ARN
ARNm complet du gène correspondant à l'ADNc 
---ADNC.ADN 
ADNc brin non transcrit correspondant à l'ARNm complet 
---COD.ADN
Partie strictement codante du brin non transcrit correspondant à l'ARNm sans la coiffe la queue polyA. Commence toujours par ATG 
---COD.ARN
ARNm correspondant à la partie strictement codante du gène sans la coiffe et la queue polyA . Commence toujours par AUG
----.PRO
Séquence protéique 
---ADN.ALN
Alignement multiple de séquences d'ADN (uniquement visualisable) 
---PRO.ALN
Alignement multiple de séquences protéiques (uniquement visualisable) 

Données disponibles
 

Thèmes
Séquences
Expression de l'information génétique  Globines humaines 
Relations génotype-phénotype  Thalassémies 
Groupes sanguins ABO 
Phénylcétonurie 
Polymorphisme des gènes  Gènes ABO 
Gène de l'Alpha-antitrypsine 
Gène de la chorée de Hunchtington (IT 15) 
Gènes HLA 
Familles multigéniques  Gènes des globines 
Gènes HLA 
Gènes des hormones hypophysaires et placentaires
Diagnostic et prévisions en génétique humaine Albinisme (généalogies de 3 familles) 
Rétinites pigmentaires (généalogies de 4 familles) 
Déficit en G6PD (généalogie d'une famille)

Nature et format des données

Le logiciel ne charge en mémoire que les fichiers de séquences se terminant par l'une des extension suivantes : .ADN, .ARN, .PRO, .COD

Un fichier de séquence est un fichier texte qui comporte optionnellement en tête des lignes de commentaire débutant par le caractère " ; " suivi d'un espace.


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