Projet et cahier des charges :

On propose de créer une page (au format HTML) permettant la visualisation dynamique du complexe enzyme-substrat  de la carboxypeptidase. La visualisation sera activée grâce à un script assurant  la coloration du site catalytique, en particulier :

• l'enzyme  devra s'afficher en squelette carboné,
• le substrat  (une glycine (GLY1) et une tyrosine (TYR2)) sera représenté en "fil de fer" (wireframe) rouge,
• le site catalytique sera précisé :
• l'atome de Zinc sera affiché en sphère  (spacefill) de couleur mauve,
• le site catalytique (His69, Glu72, His196) sera représenté en "fil de fer" jaune,
• le site de fixation (Arg145, Tyr248 et Glu270) en "fil de fer" bleu.
• les éléments affichés seront légendés.
• pour terminer le script contrôlera un zoom sur le site catalytique.

Déroulement :

Première étape, insérer la molécule 3D dans une page HTML

• Télécharger le fichier correspondant au complexe enzyme substrat de la carboxypeptidase (tp4.zip)
• Décompacter ce fichier
• Ouvrir une nouvelle page blanche à partir de votre navigateur, pour cela sélectionner le menu déroulant Fichier puis Nouveau puis l'option  Page vierge,

• Créer un titre (Visualisation dynamique du site catalytique de la carboxypeptidase) et le centrer ,
• Insérer la fenêtre d'affichage de la molécule 3D, pour cela sélectionner dans le menu déroulant l'option Insérer puis Etiquette HTML,

• Renseigner les Propriétés de l'étiquette HTML :

 

 
 
 


 

• Respecter la syntaxe comme sur l'exemple :

• Enregistrer votre fichier sous cpa.htm et tester le.
• Comparer votre travail avec l'exemple présenté ci-contre :

• Démarrer l'éditeur de texte (BlocNotes par exemple 

Rédiger votre script 
et enregistrer le sous : cpa.scr
• Insérer votre script dans la page cpa.htm, pour cela placer le curseur à l'endroit souhaité, sélectionner l'option Insérer puis Etiquette HTML
• Renseigner les propriétés de l'étiquette Html :

<EMBED type="application/x-spt" width=12 height=12 button=push  script="script 'cpa.scr'">
• Enregistrer votre travail et le texter .
• Comparer avec l'exemple ci-contre :

Sommaire

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A vous de créer maintenant... et bon courage!