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Quels caractères choisir pour faire un arbre phylogénétique ?

Pour établir des relations de parenté entre les organismes, il ne faut considérer que des caractères dits "à valeur évolutive", c'est à dire qui sont hérités d'un même ancêtre commun.

Dans la liste de caractères accessibles à partir de l'activité construire, de multiples caractères, de nature très variée, sont proposés. Parmi ceux-ci, figurent des caractères biologiques, anatomiques, comportementaux ...

Les caractères utilisables pour établir un arbre phylogénétique des Vertébrés sont les suivants : 

Allaitement - amnios - branchies - cavités du coeur - choanes - cloison oreillette - cloison ventricule - doigts - fenêtre mandibulaire - fenêtres temporales - formations dermiques - formations épidermiques - kératine - machoires - membres pairs - ongles/griffes - organe respiratoire - pièces basales - placenta - poumons - squelette 

Quels caractères choisir pour mettre en évidence les analogies ?

Pour mettre en évidence les analogies, il faut procéder de la façon suivante : 

- établir un arbre phylogénétique entre les taxons choisis, à partir de plusieurs caractères ne "posant pas de problèmes" (c'est à dire pour lesquels le problème de l'analogie ne va pas se poser pour l'échantillonnage choisi), 

- prendre en compte le caractère permettant de montrer l'analogie, et constater que si on fait des regroupements en fonction de ce caractère, on augmente le nombre de sauts évolutifs à envisager. En se basant sur le principe de parcimonie, lié à la méthde cladistique, on peut alors dire qu'il faut trouver une autre explication pour ce caractère, et que le partage d'un même état par deux organismes ne peut s'expliquer par son héritage d'un même ancêtre commun,

- les caractères suivants peuvent être utilisés : nageoires (la présence de nageoires chez le dauphin et la sardine par exemple ne traduit pas une parenté plus grande entre eux, mais est due à une convergence de forme liée à l'adaptation au milieu de vie), ailes (la présence d'ailes chez la chauve-souris et la mésange par exemple ne traduit pas une parenté plus grande entre eux, mais est due à une convergence de forme liée à l'adaptation au milieu de vie), membres pairs (l'absence de membres pairs chez les serpents et la lamproie par exemple ne traduit pas une parenté plus grande, mais est due à la régression des membres chez les serpents). 

(exemple

Comment savoir si l'arbre obtenu par les élèves est juste ?

L'arbre phylogénétique est un arbre qui traduit les parentés entre les organismes. Un arbre est juste lorsque chaque entrenoeud peut être justifié par une nouveauté évolutive (état évolué d'un caractère). A partir d'un même ensemble de taxons et de caractères, la figure obtenue peut prendre différents aspects, tout en restant juste, comme le montre l'exemple ci-dessous :




Comment ajouter un taxon ou un caractère ?

On ne peut pas facilement, dans la version actuelle, ajouter un taxon ou un caractère. 

Faites nous part de vos suggestions dans ce domaine. 

Problèmes d'impression

Phylogène ne gère pas les différents types d'imprimantes. Mais l'impression reste possible avec la plupart d'entre elles.
 
 


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