Rechercher les acides aminés impliqués dans l'interaction enzyme substrat :

 

Objectifs

Actions

Afficher le modèle "enzyme-substrat"         Identifier les acides aminés présents dans le site catalytique.

Fichier    Ouvrir         Choisir le dossier, le fichier cpasub.pdb Fichier    Atomes          Colorer par ... chaîne Afficher en sphères Cliquer sur  pour activer le mode sélection Avec le pointeur, cliquer sur l'écran et tirer pour décrire un quadrilatère englobant une portion de la molécule.  Editer, restreindre Lire dans le panneau de commande le nombre d'atomes sélectionnés.  Identifier les atomes

Résultats :
Les acides aminés présents dans le site catalytique sont His69, Glu72, Arg145, His196, Tyr248 et Glu270.
On trouve également un atome de zinc.

 

Objectif	Actions
Repérer les acides aminés impliqués dans l'interaction enzyme substrat et l'atome de zinc.	Sélectionner tous les atomes de la molécule active Afficher en sphères  Ouvrir la fenêtre de sélection d'atomes Ecrire les numéros d'ordre des acides aminés  Colorer les atomes de la sélection Choisir une couleur Ouvrir la fenêtre de sélection d'atomes  Ecrire *.zn (pour repérer l'atome de zinc) Colorer cet atome de zinc

Résultats : Le complexe enzyme-substrat et le site catalytique