Isoler le site seul et le site en présence de son substrat, superposer les modèles et enregister le script :

 

Objectifs

Actions

Isoler le site catalytique en présence de son substrat.                                                                               Ajouter dans la même fenêtre, le site catalytique seul.           Comparer les modèles.       Enregistrer le script seul ou le modèles pdb avec son script.

Fichier    Ouvrir         Choisir le dossier, le fichier cpasub.pdb Ouvrir la fenêtre de sélection d'atomes Ecrire les numéros d'ordre des acides aminés (pour repérer le site catalytique) Editer, restreindre, afficher  en bâtonnets  Ouvrir la fenêtre de sélection d'atomes  Ecrire *.zn (pour repérer l'atome de zinc) Colorer cet atome de zinc Afficher en sphère  Ouvrir la fenêtre de sélection d'atomes Ecrire *s (pour repérer le susbstrat) Afficher  en bâtonnets  Fichier    Ajouter         Choisir le dossier, le fichier cpaseul.pdb Reprendre la démarche : sélectionner les acides aminés du site catalytique, l'atome de zinc, restreindre ... Superposer les modèles     Déplacer les 2 modèles      Déplacer 1 modèle  Distance entre deux atomes       Cliquer sur le premier puis sur le second. Fichier, enregistrer le fichier sous ...

Résultat :