• Définir la notion d'acide aminé : 

Toutes les protéines de toutes les espèces, de la Bactérie à l'Homme, sont construites à partir du même groupe de 20 aminoacides. Les acides aminés sont les unités structurales de base des protéines. Un acide aminé est constitué d'une fonction amine, d'un groupe carboxyle, d'un atome d'hydrogène et d'un groupe caractéristique R, tous liés à un atome de carbone alpha. Le groupe R est considéré comme une chaîne latérale. 

L'étude comparée de quelques acides aminés avec le logiciel RasTop doit permettre de se familiariser avec la lecture des modèles moléculaires en 3d, de tels modèles en boules et bâtonnets colorés par types d'atomes, sont très proches des modèles vus en chimie.
  

Objectifs	Actions
Voir un acide aminé : faire l'inventaire des atomes, déterminer sa formule développée, identifier la molécule en utilisant une table de référence. Voir d'autres acides aminés et les identifier, chercher les points communs, les différences.	Fichier    Ouvrir         Choisir le dossier, le fichier ala.pdb Fichier    Ouvrir         Choisir le dossier, le fichier arg.pdb On peut envisager d'ajouter 2 acides aminés (voire davantage) dans la même fenêtre afin de faciliter la comparaison par superposition.

Résultats