Exemple : l'organisation spatiale de la chaîne polypeptidique 
  • Comprendre comment s'organise la chaîne polypeptidique dans l'espace : 

  • On propose d'explorer une petite molécule (un nonapeptide, 147 atomes) extraite de la globine bêta de l'hémoglobine humaine. On propose de montrer que cette chaîne n'est pas unidirectionnelle mais qu'elle a une disposition particulière dans l'espace. Devant la complexité de cette représentation, on propose de rechercher un mode simplifié de modélisation en reliant simplement les différents acrbones alpha. L'utilisation d'un script doit faciliter l'établissement du modèle en squelette carboné.
      

    Objectifs
    Actions
    Voir un nonapeptide, repérer les carbones alpha, établir un modèle en squelette carboné.
     
     
     
     
     

     

    Fichier
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            Choisir le dossier, le fichier aa1-9h.pdb

    Fichier
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             Choisir le dossier, le fichier nonapeptide.scr
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    Résultats :
    Script : étape 1

    Script : étape 2

    Script : étape 3

    Script : étape 4

       

Institut national de recherche pédagogique