• Découvrir une famille multigénique : 

Préliminaire : 
• Comparer les séquences polypeptidiques des différentes globines humaines (document 1) , construire la matrice de différences (document 2) et construire un arbre (document 3) : cette étude pourra être réalisée en utilisant le logiciel phylogène par exemple.
• Document 1

• Document 2 :




 
• Document 3 :




Les séquences peptidiques sont variables mais pourraient être homologues. Etudions les structures tridimensionnelles de quelques globine et  validons l'hypothèse d'une famille multigénique.
 
Les analogies de structure spatiale entre les différentes globines sont très marquées, notamment la distribution des hélices déterminant la poche dans laquelle se trouve logée le hème (voir : "Toutes les globines ont la même structure"). Pourtant, les structure primaires sont notablement différentes comme le montre la matrice du document 2. L'analyse des séquences de l'ensemble des globines connues montre que l'identité porte sur dix acides aminés seulement La localisation de ces acides aminés dans la structure tridimensionnelle révèle une identité remarquable de nature et de position.

Ces acides aminés "stratégiques" et leurs positions ont donc été conservées au cours de l'évolution de cette famille multigénique des globines.

On propose d'utiliser des scripts afin de découvrir et de comparer les structures tridimensionnelles des globines et de préciser les positions des acides aminés stratégiques.
 
 

Objectifs	Actions
Comparer les structures tridimensionnelles des globines humaines	Fichier    Ouvrir         Choisir le dossier, le fichier alphabetagammazeta _evol.rsm ... on pourra proposer de déplacer séparemment les différentes globines afin de constater l'existence l'analogie des structures spatiales.

Résultats 
 

Visualisation en squelettes carbonés 3 globines humaines : alpha, beta et gamma. Les acides aminés conservés au cours de l’évolution sont figurés en bâtonnets colorés en jaune.


 

Objectifs	Actions
Repérer les acides aminés "stratégiques" conservés au cours de l'évolution.	Fichier    Ouvrir         Choisir le dossier, le fichier alpha-conserv.rsm Fichier    Ouvrir         Choisir le dossier, le fichier beta-conserv.rsm Fichier    Ouvrir         Choisir le dossier, le fichier gamma-conserv.rsm Fichier    Ouvrir         Choisir le dossier, le fichier zeta-conserv.rsm Fichier    Ouvrir         Choisir le dossier, le fichier myo-conserv.rsm

Résultats