- Toutes les globines connues ont la même structure
La relation entre la disposition structurale et la fonction de la molécule n'est pas évidente si elle n'est constatée que sur un seul exemple. La banque de données permet d'explorer la disposition spatiale de la chaîne peptidique en rapport avec l'aménagement d'une poche pour l'hème et la présence systématique des mêmes acides aminés.
La découverte des mêmes structures sur des globines différentes accrédite l'idée qu'une telle disposition est en rapport avec la fonction de la molécule.
Objectifs Actions Explorer la structure de différentes globines, repérer la disposition spatiales des hélices, identifier l'hème ainsi que les acides aminés qui participent à son positionnement dans la poche. Banque de données : globines humaines (alpha, bêta, gamma, zeta, myoglobine), globines d'Oie (alpha et bêta), diverses myoglobines (Cachalot, Cheval, Phoque, Porc, Requin et Tortue).
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Sélectionner un fichier correspondant à la globine à étudier:
- Globines d'Homme : alphahom.pdb, betahom.pdb, gammahom.pdb, zetahom.pdb et myohome.pdb;
- Globines d'Oie : alphaoie.pdb, betaoie.pdb.
- Myoglobines de divers Vertébrés : myocach.pdb, myocheval.pdb, myophoq.pdb, myoporc.pdb, myorequin.pdb et myotortue.pdb.
Charger le script correspondant en respectant les indications suivantes :
- alpha_str.scr ou helices_alpha.scr pour toutes les globines alpha et les globines zeta;
- beta_stra.scr ou helices_beta.scr pour toutes les globines beta et gamma ainsi que pour la myoglobine de Cachalot;
- myo_str.scr ou helices_myo.scr pour toutes les myoglobines sauf celle de Cachalot.
Résultat:
Quatre globines humaines : de gauche à droite, une glogine alpha, une globine bêta, une globine gamma et une globine zeta.
Légendes : squelette carboné en gris, histidine en rouge, hème en CPK et atome de fer en jaune.
Quatre globines humaines : de gauche à droite, une glogine alpha, une globine bêta, une globine gamma et une globine zeta.
Légendes : Modèles en ruban, chaque couleur correspond à une hélice (7 hélices pour les globines alpha et zeta, 8 hélices pour les globines bêta et gamma).
Six myoglobines de Vertébrés : de gauche à droite, myoglobine d'Homme, de Cachalot, de Cheval, Phoque, de Porc et de Requin.
Légendes : Modèles en ruban, chaque couleur correspond à une hélice (8 hélices).
