Exemple : Initiation à la représentation et à la lecture des structures d'une protéine : l'hémoglobine 
  • Initiation à la lecture des modèles moléculaires en 3d

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    Il existe de très nombreuses modalités d'affichage des modèles moléculaires : sphères (rayons fixes ou rayons de Van der Waals), boules et bâtonnets, bâtonnets,  fil de fer, squelette carboné, ruban, brins, points, ... La connaissance de ces modalités est indispensable pour une exploitation des modèles moléculaires. 

    On propose d'explorer une petite molécule (un nonapeptide, 147 atomes) et de comparer quelques modalités d'affichage afin d'expliquer à quoi elles correspondent.
     

    Objectifs
    Actions
    Voir un nonapeptide en sphères (rayons de Van der Waals), en boules et bâtonnets, en fil de fer (carbones alphas marqués) et en squelette carboné.
     

     

    Fichier
       Ouvrir
    Sélectionner initiation_lecture.rsm

    On peut réaliser simplement ce travail en ouvrant 4 fois le fichier aa19h.pdb dans la même fenêtre: déplacer et orienter les 4 modèles afin de pouvoir les observer séparément, affecter un mode d'affichage différent pour chaque modèle.

    Résultat :
    Nonapeptide : différentes modalités d'affichage.


Institut national de recherche pédagogique