Maintien des mutations au cours de l'évolution 

Exemple des gènes de globine
La comparaison (avec Anagène) des séquences protéiques de bêta globine de différents Vertébrés permet de constater l'existence de sites particulièrement variables et de sites particulièrement conservés.

La localisation de ces sites sur une molécule de bêta globine permet de discuter du maintien des mutations apparues dans le gène de la bêta globine.

La fiche technique suivante permet de mettre en évidence les sites suivants sur une molécule de bêta globine humaine :

  • sites conservés (seront représentés en sphères rouges) : 32 à 41 (incluant la méthionine initiale) - 62 à 64 - 66 à 68 - 94 à 100 - 106 à 107 - 140 à 141 
  • sites très variables (seront représentés en sphères bleues) : 2 à 3 - 55 à 56 - 125 à 126 - 130 
1 - Ouvrir un fichier de molécule de betaglobine humaine ("beta.pdb" par exemple)

2 - Un affichage en squelette carboné facilitera le repérage des sites sur la molécule :

  • Rubans - Type - Squelette carboné
  • Rubans - afficher
3 - L'affichage du groupement hème permettra de repérer la poche de l'hème (voir) :
  • cliquer sur l'icône "expression"
  • taper: hetero (sans accent)
  • valider (OK)
  • vérifier que la sélection a été faite
  • cliquer sur l'icône qui permet l'affichage de la sélection en sphères
4 - Sélection des sites et mise en évidence (voir) :
  • cliquer sur l'icône "expression"
  • taper le numéro des acides aminés limitant le site (exemple : 32-41)
  • valider (OK)
  • vérifier que la sélection est bien faite
  • cliquer sur l'icône de choix des couleurs affectées à la sélection et choisir la couleur désirée
  • répéter l'opération pour chaque nouveau site 

 
Institut national de recherche pédagogique