Localisation des parties variables et hypervariables dans une molécule d'IgG

(On ne travaillera ici que sur les fragments FAB de la molécule d'IgG)

La comparaison (avec Anagène) de chaînes légères et de chaînes lourdes de plusieurs IgG humaines différentes contre le SIDA permet de repérer une partie constante d'une IgG à l'autre et une partie variable (des acides aminés 1 à 116 pour les chaînes lourdes ; de 1 à 111 pour les chaînes légères).

1 - Ouvrir le fichier correspondant au fragment FAB associé à l'antigène (1ACY_gp120 par exemple, soit le fragment FAB d'une IgG capable de fixer spécifiquement l'antigène gp120 de l'enveloppe virale du VIH)

2 - Mettre en évidence des différentes chaînes affichées:

3 - Repérer les chaînes lourdes et légères, ainsi que l'antigène : 4 - Colorer spécifiquement la partie variable de la chaîne légère de l'IgG (Voir) 5 - Colorer spécifiquement la partie variable de la chaîne lourde de l'IgG Voir le résultat final

6 - Procéder de la même façon pour les parties hypervariables (sites : 32 à 35, 97 à 99 par exemple pour les chaînes lourdes ; sites 32 à 35 ; 96 à 98 par exemple pour les chaînes légères ; séquences repérées lors de la comparaison des parties variables des chaînes lourdes et légères de plusieurs IgG avec le logiciel Anagène).

Voir le résultat final

7 - Conclusion : les parties variables et hypervariables de la molécule d'IgG se situent au niveau du site antigénique, ce qui permet d'expliquer la spécificité de cette molécule.