SEQAID II - Minidoc

Présentation

Réalisé par D.D. Rhoads et D.J. Rouffa (Université du Kansas) SEQAIDII est un logiciel d'analyse de séquences qui met en oeuvre des traitements simples. Deux versions du logiciel en français ont été diffusées en 1993 et en 1995 (version courante 1.1). Elles sont associées à une banque de séquences nucléiques et protéiques regroupées par niveau et par thème d'étude.

Les applications pédagogiques proposées correspondent à des sujets traités dans le cadre des programmes actuels des classes de première et de terminale.

Manuels d'exploitation pédagogique

• J-C Hervé, N. Salamé, B. Therrié : Analyses de séquences de gènes et de protéines avec le logiciel Seqaid II. INRP, 1993. Publication accompagnée de la Version 1.0 du logiciel et d'une mini banque de données.
• J-C Hervé, N. Salamé, B. Therrié : Seqaid II : thèmes d'études en génétique humaine. INRP 1995. Publication accompagnée d'une nouvelle version du logiciel et d'une vaste banque de séquences.

Téléchargement du logiciel et des données

Matériel d'exploitation

• PC Ecran couleur VGA (résolution écran conseillée : 600 x 800 pixels)
• 4 Mo de RAM, 1,6 Mo sur le disque dur
• Lecteur de disquette 3'1/2

Installation sur disque dur

A partir de la version téléchargée

• Créer un répertoire Seqaid
• Y placer les fichiers téléchargés
• Décompacter les fichiers dans ce répertoire avec PKUNZIP ou WINZIP

(les sous-répertoires sont créés automatiquement)

A partir des disquettes

• suivre les indications du fichier installe.exe.

1. Placer la disquette "Programme" dans le lecteur A, par exemple
2. Sous DOS, dans le répertoire Seqaid, taper xcopy a:*.* /s
3. Répéter la commande avec la disquette "Données"

Lancement

• Sous DOS : se placer dans le répertoire Seqaid et taper seqaid
• Sous Windows : cliquer sur le fichier seqaid.exe, ou sur un raccourci vers ce fichier