Une immunoglobuline et son antigène :
la fixation de l'antigène

Voir le Fab et son antigène

On exploite ici une image correspondant à une "branche du Y" (fragment Fab).
  La visualisation de l'ensemble "Fab-antigène" (en sphères colorées par chaîne) montre que l'antigène est positionné à l'extrémité du Fab de l'anticorps, ce qui permet de s'interroger sur l'existence de relations étroites entre l'antigène et l'anticorps.

  Légendes on
  Légendes off
  Avec la représentation en squelette carboné, une rotation autour d'un axe Oy montre que la surface de l'antigène en regard du fragment Fab présente une certaine complémentarité de forme avec celui-ci. Il y a donc un "motif moléculaire" de l'antigène, le site antigénique, "reconnu" par l'anticorps au niveau d'un site de reconnaissance.

  Une quinzaine d'acides aminés en regard du site antigénique sont impliqués au niveau du site de reconnaissance. Ces acides aminés sont répartis en six boucles appartenant à la chaîne H (lourde) et à la chaîne L (légère).
 
Site de reconnaissance porté par l'anticorps (fragment Fab)
Chaîne L
  Boucle 1 : His30, Tyr32
  Boucle 2 : Tyr50
  Boucle 3 : Phe91, Trp92, Ser93
Chaîne H
  Boucle 3 : Arg99, Asp100, Tyr101, Arg102
  Boucle 2 : Trp52, Gly53, Asp54
  Boucle 1 : Gly31, Tyr32
Site antigénique porté par l'antigène
(lysozyme de blanc d'oeuf de Poule)
  Leu129, Leu25
  Asp18, Asn19
  Gln121, Ile124
  Asn19, Arg21, Gly22, Tyr23
  Ser24, Asn27, Val120, Gln121
  Thr118, Asp119
  Lys116, Gly117

En résumé, il existe un motif moléculaire au niveau de l'antigène qui est reconnu par l'immunoglobuline et qui comporte un petit nombre d'acides aminés: c'est le site antigénique. Ce motif présente une complémentarité spatiale avec les parties apicales de la molécule d'immunoglobuline au niveau du site de reconnaissance mettant en jeu des acides aminés appartenant aux deux chaînes au niveau des boucles.

Voir  l'immunoglobuline.



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