Créer un script

Le projet :

Le script que l'on souhaite créer devra afficher une globine bêta de l'hémoglobine humaine en rubans, l'hème en "fil de fer" rouge et l'atome de fer en sphère  bleue. Par ailleurs, ce script devra montrer la présence de 8 hélices.
 

  • hélice A (aa n°4 à n°18) en rouge

  •  
  • hélice B (aa n°19 à n°34) en bleu

  •  
  • hélice C (aa n°35 à n°41) en jaune

  •  
  • hélice D (aa n°50 à n°56) en vert

  •  
  • hélice E(aa n°57 à n°76) en orange

  •  
  • hélice F(aa n°85 à n°93) en magenta

  •  
  • hélice G(aa n°99 à n°117) en cyan

  •  
  • hélice H(aa n°123 à n°143) en pourpre
  • Les huit hélices alpha de la globine beta

    Démonstration :



    Présentation du script et commentaires:
     

    Le script Les commentaires
    select all 
    reset 
    wireframe off 
    spacefill off 
    ribbons on 
    ribbons 200 
    color white 

    select hem 
    wireframe 0.3 
    color red 
    select *.fe 
    spacefill 
    color blue 

    select 4-18 
    color red 

    select 19-34 
    color blue 

    select 35-41 
    color yellow 

    select 50-56 
    color green 

    select 57-76 
    color orange 

    select 85-93 
    color magenta 

    select 99-117 
    color cyan 

    select 123-143 
    color purple 

    move 0 -360 0 0 0 0 0 0 3 60 
    reset 

    Sélection de tous les atomes 
    Réinitialisation de la molécule 
    Affichage en bâtonnets désactivé 
    Affichage en sphères désactivé 
    Affichage en ruban activé 
    Largeur du ruban 200 
    Coloration du ruban blanche 

    Sélection de l'hème 
    Affichage de l'hème en bâtonnets de taille 0.3 
    Sélection de l'atome de fer 
    Affichage de l'atome sélectionné en sphère 
    Affichage de l'atome de fer en bleu 
     

    Sélection de la première hélice (aa4 à aa18) 
    Coloration de l'hélice A(aa n°4 à n°18) en rouge 

    Sélection de la deuxième hélice (aa19 à aa34) 
    Coloration de l'hélice B(aa n°19 à n°34) en bleu 

    Sélection de la troisième hélice (aa35à aa41) 
    Coloration de l'hélice C(aa n°35 à n°41) en jaune 

    Sélection de la quatrième hélice (aa50 à aa56) 
    Coloration de l'hélice D(aa n°50 à n°56) en vert 

    Sélection de la cinquième hélice (aa57 à aa76) 
    Coloration de l'hélice E(aa n°57 à n°76) en orange 

    Sélection de la sixième hélice (aa85à aa93) 
    Coloration de l'hélice F(aa n°85 à n°93) en magenta 

    Sélection de la septième hélice (aa99à aa117) 
    Coloration de l'hélice G(aa n°99 à n°117) en cyan 

    Sélection de la huitième hélice (aa123 à aa143) 
    Coloration de l'hélice H(aa n°123 à n°143) en pourpre 

    Mise en rotation de la molécule 
    Réinitialisation

     Réalisation du script :

    SommaireRetour au sommaire
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