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Fonctionnement de Chime

Tutoriel pour l'utilisation de Chime

- Visualisation
- Activation
- Réalisation

Si Chime est installé sur votre machine, vous verrez une molécule au milieu du tableau, sinon c'est une pièce de puzzle qui est affichée.
 

Rotations avec la souris Clic bouton gauche  Rotation en X Rotation en Y	Menu Clic sur le bouton droit dans  la fenêtre de la molécule	Raccourcis souris Shift - bouton gauche : zoom  Shift - bouton droit : rotation en Z Ctrl - bouton droit : translation
Menu Display (afficher)  Wireframe (fil de fer)  Sticks (bâtonnets)  Balls & sticks (boules et ...)  Spacefill (sphères)  Backbone (squelette carboné)  Ribbons (rubans)  Strands (brins)  Cartoon	Afficher en sphères	Menu Color CPK (conventionnelle)  Amino acid  Shapely (forme)  Group  Chain  Temperature  Structure (hélices, feuillets...)
Menu Options  : Display hydrogens ; Display hydrogen bonds ; Display hydrogen bridges  Dot surface (surface en points) ; Slab (coupe) ; Specular (reflets) ; Shadow (ombrage) ; Stereo.  Menu Select : en particulier, change color to ...

Activation de Chime
 

Invocation de Chime dans une page HTML	Lancement de scripts avec des boutons	Texte d'un script pour Rasmol/Chime
<EMBED src="leuenk.pdb"  bgcolor="#000000"  width=200  height=200  name="chime_graphic"  spiny=15  startspin=true	<EMBED type="application/x-spt" width=10 height=10 button=push target="chimexpl.htm" script="script 'exemple.scr'"> Le bouton sous la molécule active le script ci contre	select all spacefill color cpk move 0 -360 0 0 0 0 0 0 3 60 delay 1 zoom 200 delay 1 reset

Noter que :

Les coordonnées spatiales de la molécule (plusieurs centaines de ko parfois) sont envoyées par le serveur sur le poste client.

Les scripts de Chime acceptent toutes les commandes de Rasmol. Ils sont écrits avec un éditeur de texte et sauvegardés au format texte.
 

Logiciels et données  Autoformation Education interactive