Un des axes fort du projet ERT ACCES est l'opérationnalisation des notions et concepts dégagés au cours de l'approche scientifique du domaine choisi. Cette opérationnalisation peut passer par la recherche d'outils logiciel utilisés dans le monde de la recherche scientifique et que quelques adaptations pourraient permettre une utilisation dans le monde de l'enseignement.

Nous avons donc référencé les outils de modélisation de la cellule. Ces logiciels (e-cell, virtual cell) sont souvent tournés vers une approche moléculaire des mécanismes cellulaires. Nous avons donc retenu deux logiciels :

• Immsim++: logiciel de modélisation de la réponse immunitaire à médiation humorale.
• Biodyn : logiciel de modélisation permettant la mise en interaction d'objets biologiques paramétrables