Dans différentes régions du monde, il existe deux ou plusieurs allèles du gène G6PD avec une fréquence supérieure à 1%. Dans ces régions, ce gène est donc polymorphe.

Le traitement des séquences nucléiques avec Anagène permet de mettre en évidence les différences entre allèles et leurs conséquences au niveau phénotypique.

Les divers allèles diffèrent de G6PD-B par une ou plusieurs substitutions de nucléotides qui entraînent des substitutions portant sur un ou plusieurs acides aminés (mutations faux sens).

La filiation entre les allèles (à construire avec les élèves) peut être représentée de la manière suivante :