Une comparaison plus
précise permet d'évaluer le nombre de différences
(ou le nombre de similitudes) entre ces molécules protéiques,
ou nucléiques). Les résultats sont présentés
dans une matrice :

Les parentés entre ces gènes (ou entre ces protéines)
peuvent alors être précisées an appliquant le principe
suivant : plus il y a de similitudes et plus la parenté est grande
: