Exemple : l'hémoglobine est formée de 4 chaînes polypeptidiques identiques 2 à 2 
 
  • Voir une molécule d'hémoglobine : 

  • On étudie une des 280 millions d'hémoglobine qui entrent dans la composition du cytosol d'une hématie humaine. La visualisation en fil de fer puis en sphères montre la complexité de cette structure : elle apparaît très buissonnante et compacte. Le modèle fait ressortir l'aspect globulaire de la molécule. 
    La coloration par types d'atomes permet d'identifier le carbone, l'oxygène, l'azote.
    La coloration par chaînes permet d'identifier 4 chaînes.
    La lecture de la séquence permet de repérer que les chaînes sont 2 à 2 identiques : les 2 chaînes de 141 acides aminés sont appelées les globines alpha,  les 2 chaînes de 146 acides aminés sont appelées les globines beta.
    Des extractions des motifs rentrant dans la composition de l'hémoglobine pemet de montrer que l'hémoglobine est formée d'acides aminés. 

    Objectifs
    Actions
    Voir une molécule d'hémoglobine, découvrir son aspect globulaire, découvrir les 4 chaînes.
     

     

    Fichier
       Ouvrir
            Choisir le dossier, le fichier hbn.pdb
    Afficher en sphères 
       Atomes
             Colorer par ... Chaîne
    Lire les séquences et découvrir l'existence de 4 chaînes 2 à 2 identiques : 2 globines alpha et 2 globines beta.
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     

     

    Molécule
       Séquence
       Repérer quelques acides aminés 


    Compléter la saisie des information : 
        Molécule puis Informations

    Isoler quelques acides aminés
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     
     

     

    Sélectionner 
    Ecrire val1 and *a pour sélectionner le premier acide aminé de la chaîne A

    Restreindre le modèle à cet acide aminé
    Afficher boules et bâtonnets

    Sélectionner tout 
    Sélectionner un autre acide aminé

    Résultats 

    L'hémoglobine est un tétramère formé par l'association de quatre chaînes polypeptidiques identiques deux à deux : deux chaînes alpha (globines alpha) composées de 141 acides aminés et deux chaînes bêta (globines bêta) de 146 acides aminés.

       

Institut national de recherche pédagogique