Exemple : Initiation à la représentation et à la lecture des structures d'une protéine : l'hémoglobine 
  • Les protéines sont formées à partir d'un répertoire de 20 acides aminés 

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    Toutes les protéines de toutes les espèces, de la Bactérie à l'Homme, sont construites à partir du même groupe de 20 aminoacides. Les acides aminés sont les unités structurales de base des protéines. Un acide aminé est constitué d'une fonction amine, d'un groupe carboxyle, d'un atome d'hydrogène et d'un groupe caractéristique R, tous liés à un atome de carbone alpha. Le groupe R est considéré comme une chaîne latérale. 

    L'étude comparée de quelques acides aminés avec le logiciel RasTop doit permettre de se familiariser avec la lecture des modèles moléculaires en 3d, de tels modèles en boules et bâtonnets colorés par types d'atomes, sont très proches des modèles vus en chimie.
     

    Objectifs
    Actions
    Voir tous les acides aminés :
    • Chercher les similitudes : la fonction amine, le groupe carboxyle, l'hydrogène et le carbone alpha;
    • Chercher les différences : comparer les chaînes latérales;
    • Nommer quelques acides aminés.

     
     
     

     

    Fichier Ouvrir 
    Sélectionner le fichier tous_aa.srm

    Observer séparément chaque molécule et l'identifier.

    Comparer les acides aminés entre eux :

    - Sélectionner une molécule 
    - Modifier l'option "univers off" 
    - Déplacer la molécule (rotations, translations, ...)
    - Superposer la molécule sélectionnée avec une autre de votre choix ... 

    Résultat 


Institut national de recherche pédagogique