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Comprendre comment s'enchaînent
les acides aminés :
L'étude est réalisée
sur des peptides extraits de la chaîne bêta de l'hémoglobine
humaine. On propose d'étudier d'abord le dipeptide, d'identifier
les acides aminés et la liaison CO-NH dite peptidique. Les analyses
successives du tripeptide jusqu'à l'hexapeptide permet de préciser
la liaison peptidique. On constate que cette chaîne peptidique n'est
pas linéaire, sa disposition dans l'espace est complexe.
Au cours de cet exercice,
on pourra se familiariser avec la lecture de modèles de plus en
plus complexes (du dipeptide qui possède 36 atomes au nonapeptide
qui en compte 147).
Objectifs
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Actions
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Voir 2 acides aminés
et comprendre comment ils s'enchaînent au niveau d'un dipeptide.
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Fichier
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Choisir le dossier, le fichier dipeptide.rsm
On propose de déplacer
chaque acide aminé dans la position qu'il occupe au niveau du dipeptide
et de découvrir comment la valine s'enchaîne à l'histidine. |
Résultat
:
Objectifs
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Actions
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Voir 3 acides aminés
et comprendre comment ils s'enchaînent au niveau d'un tripeptide.
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Fichier
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Choisir le dossier, le fichier tripeptide.rsm
De même, on propose
de déplacer chaque acide aminé dans la position qu'il occupe
au niveau du tripeptide et de découvrir comment s'enchaînent
la valine, l'histidine et la leucine. |
Résultat
:
Objectifs
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Actions
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Voir 4 acides aminés
et comprendre comment ils s'enchaînent au niveau d'un tétrapeptide.
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Fichier
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Choisir le dossier, le fichier tetrapeptide.rsm
.. et ainsi de suite,
on propose de déplacer chaque acide aminé dans la position
qu'il occupe au niveau du tétrapeptide et de découvrir comment
s'enchaînent la valine, l'histidine, la leucine et la thréonine. |
Résultat
:
Objectifs
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Actions
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Voir 5 acides aminés
et comprendre comment ils s'enchaînent au niveau d'un pentapeptide. |
Fichier
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Choisir le dossier, le fichier pentapeptide.rsm
...et ainsi de suite,
on propose de déplacer chaque acide aminé dans la position
qu'il occupe au niveau du pentapeptide et de découvrir comment s'enchaînent
la valine, l'histidine, la leucine, la thréonine et la proline. |
Résultat
:
Objectifs
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Actions
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Voir 6 acides aminés
et comprendre comment ils s'enchaînent au niveau d'un hexapeptide. |
Fichier
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Choisir le dossier, le fichier hexapeptide.rsm
...et ainsi de suite,
on propose de déplacer chaque acide aminé dans la position
qu'il occupe au niveau du pentapeptide afin de découvrir comment
s'enchaînent la valine, l'histidine, la leucine, la thréonine,
proline et l'acide glutamique.
...on découvre
ainsi que les acides aminés s'enchaînent les uns aux autres
grâce à des liaisons convalentes, les liaisons peptidiques.
...on découvre
enfin que l'enchaînement des acides aminés n'est pas linéaire,
la structure spatiale est complexe. |
Résultat
:
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