Exemple : la chaîne polypeptidique 
  • Comprendre comment s'enchaînent les acides aminés : 

  • L'étude est réalisée sur des peptides extraits de la chaîne bêta de l'hémoglobine humaine. On propose d'étudier d'abord le dipeptide, d'identifier les acides aminés et la liaison CO-NH dite peptidique. Les analyses successives du tripeptide jusqu'à l'hexapeptide permet de préciser la liaison peptidique. On constate que cette chaîne peptidique n'est pas linéaire, sa disposition dans l'espace est complexe.

    Au cours de cet exercice, on pourra se familiariser avec la lecture de modèles de plus en plus complexes (du dipeptide qui possède 36 atomes au nonapeptide qui en compte 147). 

    Objectifs
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    Voir 2 acides aminés et comprendre comment ils s'enchaînent au niveau d'un dipeptide.
     
     

     

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    On propose de déplacer chaque acide aminé dans la position qu'il occupe au niveau du dipeptide et de découvrir comment la valine s'enchaîne à l'histidine.
    Résultat :

    Le dipeptide et ses 2 acides aminés libres

     
    Objectifs
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    Voir 3 acides aminés et comprendre comment ils s'enchaînent au niveau d'un tripeptide.
     
     

     

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            Choisir le dossier, le fichier tripeptide.rsm
    De même, on propose de déplacer chaque acide aminé dans la position qu'il occupe au niveau du tripeptide et de découvrir comment s'enchaînent la valine, l'histidine et la leucine.
    Résultat :
    Le tripeptide et ses 3 acides aminés libres
     
    Objectifs
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    Voir 4 acides aminés et comprendre comment ils s'enchaînent au niveau d'un tétrapeptide.
     

     

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    .. et ainsi de suite, on propose de déplacer chaque acide aminé dans la position qu'il occupe au niveau du tétrapeptide et de découvrir comment s'enchaînent la valine, l'histidine, la leucine et la thréonine.
    Résultat :
    Le tétrapeptide et ses 4 acides aminés libres
     
    Objectifs
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    Voir 5 acides aminés et comprendre comment ils s'enchaînent au niveau d'un pentapeptide. Fichier
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            Choisir le dossier, le fichier pentapeptide.rsm
    ...et ainsi de suite, on propose de déplacer chaque acide aminé dans la position qu'il occupe au niveau du pentapeptide et de découvrir comment s'enchaînent la valine, l'histidine, la leucine, la thréonine et la proline.
    Résultat :
    Le pentapeptide et ses 5 acides aminés libres
     
    Objectifs
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    Voir 6 acides aminés et comprendre comment ils s'enchaînent au niveau d'un hexapeptide. Fichier
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            Choisir le dossier, le fichier hexapeptide.rsm
    ...et ainsi de suite, on propose de déplacer chaque acide aminé dans la position qu'il occupe au niveau du pentapeptide afin de découvrir comment s'enchaînent la valine, l'histidine, la leucine, la thréonine, proline et l'acide glutamique.
    ...on découvre ainsi que les acides aminés s'enchaînent les uns aux autres grâce à des liaisons convalentes, les liaisons peptidiques. 
    ...on découvre enfin que l'enchaînement des acides aminés n'est pas linéaire, la structure spatiale est complexe.
    Résultat :
    L'hexapeptide et ses 6 acides aminés libres
       

Institut national de recherche pédagogique