• Comparer l'enzyme de référence et l'enzyme mutée

Le système de surveillance de l'intégrité de la cellule met en jeu l'activation de gènes chargés d'arrêter le cycle cellulaire, le temps d'exécuter les travauxde réparation, ou de conduire à l'élimination de la cellule si celle-ci est trop endommagée (apoptose ou suicide cellulaire). Parmi les très nombreux gènes participant au contrôle de la réponse cellulaire aux mutations, les gènes cibles de la protéine p53 sont très étudiés. Le modèle que nous étudions ici montre un gène cible de la protéine p53 en présence de trois protéines p53. Ce modèle doit nous permettre de comprendre pourquoi certaines mutations de la protéine p53 sont directement impliquées dans l'apparition de certains cancers. 

 

Objectifs	Actions
Repérer les chaînes : 3 protéines p53 (bleu foncé, bleu, vert) proches d'une molécule d'ADN (jaune et ocre). A partir d'une protéine p53 isolée, comprendre la structure de la protéine : Repérer deux ensembles de feuillets beta : le premier en bleu, le seconden vert Repérer à proximité de l'ADN, une boucle constituée d'un motif "hélicea/feuilletsb" : en mauve Repérer un ion zinc (sphère rouge) niché entre 2 boucles et une courte hélice alpha (bleu foncé)  Repérer 4 résidus assurant le positionnement du zinc:  3 cysteines et 1 histidine (boules et bâtonnets, couleurs ocre et jaune) Repérer la zone de contact entre l'hélice alpha (en pourpre) et l'ADN	Fichier     Ouvrir          Choisir le dossier, le fichier p53.pdb Fichier     Charger un script           Choisir le dossier, le fichier structure.scr Pour faire progresser le script jusqu'à son terme, agir sur la barre d'espacement.
Localiser les points chauds de la molécule :  Position des résidus mutés Fréquence constatée dans l'apparition d'un cancer Arg-175 6.1% Gly-245 6.0% Arg-248 9.6% Arg-249 5.6% Arg-273 8.8% Arg-282 4.0%	Fichier     Ouvrir          Choisir le dossier, le fichier pointschauds_p53.rsm

Résultats :
 

Structure de la protéine p53	Localisation des points chauds