On effectue une coloration sélective des acides aminés 1 à 115 des chaînes alphas et des acides aminés 1 à 106 des chaînes bêtas, sur des molécules 3D de TCR. Les atomes des régions colorées sélectivement sont représentés par des sphères rouges dans le cas des chaines alphas et par des sphères bleues dans le cas des chaines bêtas. Le reste de la molécule est représenté en ruban, avec une couleur différente pour chacune des chaînes.