Mise
à jour : 23/10/2001
Glossaire
Histoire
Téléchargements
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Génotype
- phénotype - environnement
Démarche proposée par Jacques
Barrère, Lycée P-L. Courier, TOURS
Le phénotype dépend de protéines
et peut se définir à plusieurs niveaux
L'activité des protéines contribue
à la réalisation du phénotype
Les relations gène/phénotype moléculaire
Il existe des relations de dominance/récessivité
entre les allèles
Influence de l'environnement sur le phénotype
Un phénotype macroscopique donné
résulte de processus biologiques gouvernés par l'expression
de plusieurs gènes
Le phénotype dépend de protéines
et peut se définir à plusieurs niveaux
Ressources |
Activités et résultats |
Textes
(Dans la synthèse)
Décrivant les signes cliniques de la maladie, accompagnés
d'une microphotographie montrant des hématies
falciformes et d'une microphotographie montrant
des polymères d'hémoglobine. |
Dégager les différents niveaux du phénotype :
macroscopique : signes cliniques.
microscopique : hématies falciformes.
moléculaire : hémoglobine anormale.
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Conclusions
-
Le phénotype dépend de protéines et peut se définir
à plusieurs niveaux (macroscopique, cellulaire, moléculaire)
-
Le phénotype moléculaire correspond à la protéine
synthétisée à partir du gène considéré,
et permet de comprendre les phénotypes aux autres niveaux (l'hémoglobine
forme des "baguettes" ce qui déforme les hématies, la circulation
sanguine est perturbée, la durée de vie des hématies
est réduite et le sujet est anémié, les organes sont
mal irrigués, le sujet est malade : palpitations cardiaques, essoufflements,
maux de tête).
La détermination du phénotype
moléculaire
Ressources |
Activités et résultats |
Données génétiques
Téléchargeables
Séquences nucléiques des allèles HbA, HbS ;
séquences protéiques des globines bêta ; différents
génotypes déterminant le phénotype drépanocytaire.
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Comparer les séquences des allèles HbA et HbS.
Comparer les séquences protéiques des globines bêta
correspondantes.
Etablir les génotypes possibles des sujets atteints de drépanocytose,
relier génotype(s) et phénotype. |
Conclusions
-
La globine bêta de l'hémoglobine est une protéine :
elle est le produit de l'expression d'un gène.
-
La séquence de nucléotides du gène détermine
la séquence d'acides aminés de la protéine.
-
Le génotype détermine donc le phénotype moléculaire.
-
Des sujets atteints de drépanocytose, ayant donc le même phénotype
clinique, peuvent avoir des génotypes différents : 70% d'entre
eux ont un génotype HbS/HbS, 25% HbS/HbC et 5% HbS/Hb-Thalassémie.
Les relations de dominance/récessivité
entre les allèles d'un gène
Ressources |
Activités et résultats |
Généalogie
Téléchargeables
Séquences nucléiques du gène codant pour la
globine bêta pour différents membres d'une même famille. |
Déterminer les génotypes de chaque individu de cette
famille en comparant leurs allèles aux allèles de référence.
Discuter des relations de dominance / récessivité entre
les allèles HbA HbS en comparant génotype et phénotype
de chaque individu. |
Conclusion
-
au niveau du phénotype clinique, chez un hétérozygote
(HbA/HbS), le phénotype correspond à celui d'un individu
(HbA/HbA). On peut donc considérer que, à ce niveau, l'allèle
HbA est dominant.
un même phénotype peut correspondre à plusieurs
génotypes
Les propriétés des protéines
contribuent à la réalisation du phénotype
Ressources |
Activités et résultats |
Modèles 3D
Téléchargeables
Exploitables avec Rasmol ou avec Chime : globines bêta (normale
ou mutée) ; hémoglobines (normale ou mutée) ; polymère
d'hémoglobine mutée.
NB : La visualisation en ligne affiche un modèle en squelette
carboné (fichiers de 14 à 51Ko). L'affichage d'un modèle
complet (fichiers de 78 à 730 Ko) est à réserver pour
le téléchargement de la molécule ou le travail en
local.
Initiation à la lecture des structures
moléculaires
1 - l'hémoglobine
2 - l'hème
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Dégager les différents niveaux de
structure d'une protéine de référence :
-
structure primaire,
-
structure secondaire (hélice alpha),
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structure tertiaire : molécule globulaire avec une poche hydrophobe
où se trouve logé un hème,
-
structure quaternaire : hétérotétramère a2b2.
Mettre en relation la structure d'une globine
avec sa fonction.
-
Explorer la structure de l'hémoglobine, repérer l'héme
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La comparaison des molécules normale et
mutée
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Comparer et conclure
-
La structure 3D de la globine b normale à
celle de la globine b mutée,
-
La structure 3D de l'hémoglobine normale à celle de l'hémoglobine
mutée.
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Les nouvelles propriétés de la
molécule mutée
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Chercher à expliquer pourquoi l'hémoglobine
porteuse de deux globines b mutées peut
se polymériser.
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Conclusions
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Les propriétés des protéines
dépendent de leur structure.
-
La structure spatiale de la protéine n'est
pas modifiée par le remplacement Glu6Val.
-
Le phénotype moléculaire permet d'expliquer
la polymérisation de l'hémoglobine (présence d'un
résidu hydrophobe à la surface de l'hémoglobine remplaçant
un résidu hydrophile) et de comprendre les phénotypes aux
différents niveaux (l'hémoglobine forme des "baguettes"
ce qui déforme les hématies, la circulation sanguine est
perturbée, la durée de vie des hématies est réduite
et le sujet est anémié, les organes sont mal irrigués,
le sujet est malade : palpitations cardiaques, essoufflements, maux de
tête).
Influence de l'environnement sur le phénotype
Ressources |
Activités et résultats |
Données physicochimiques
(Dans la synthèse)
-
Texte : environnement direct de la molécule (à l'intérieur
de l'hématie)
-
Texte : environnement du sujet malade
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Montrer que le phénotype, qui dépend de l'expression
d'un gène, dépend également de l'environnement physicochimique
de l'hématie qui dépend lui-même de l'environnement
de l'individu.
Consulter les données et montrer que les signes cliniques de
la maladie n'apparaissent que dans certaines conditions mettant en jeu
des facteurs environnementaux. |
Conclusion
Certains facteurs de l'environnement peuvent avoir une action au niveau
du phénotype moléculaire : ainsi, une baisse de la teneur
en dioxygène (activité sportive, déshydratation, fièvre,
altitude,...) est nécessaire à la polymérisation de
HbS et donc à la falciformation.
Le phénotype biochimique, le phénotype cellulaire et le
phénotype clinique dépendent du génotype et de l'action
de l'environnement.
Un phénotype macroscopique donné
résulte de processus biologiques gouvernés par l'expression
de plusieurs gènes
Ressources |
Activités et résultats |
Données cliniques
(Dans la synthèse)
Informations et étude épidémiologique concernant
la poursuite de synthèse d'hémoglobine foetale chez certains
sujets ayant pour génotype HbS/HbS. |
Etudier les données épidémiologiques et montrer
que le phénotype peut dépendre de l'expression de plusieurs
gènes.
Consulter de données cliniques et montrer que les troubles
dus à la présence d'HbS peuvent être compensés
par la poursuite de synthèse d'hémoglobine foetale constituée
de globines alpha et gamma. |
Conclusion
La réalisation d'un phénotype au niveau cellulaire, biochimique
ou macroscopique résulte de l'intervention de plusieurs gènes.
Chaque gène impliqué code pour une molécule protéique
ayant un rôle particulier dans la réalisation de ce phénotype.
Dans certains cas, les troubles dus à la présence d'HbS (phénotype
drépanocytaire) peuvent être compensés par la poursuite
de synthèse d'hémoglobine foetale constituée de globines
alpha et gamma (phénotype normal).
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