La seconde mission s’est déroulée du 17 octobre au 13 novembre 2005. Rufino Pineda et moi-même avions trois objectifs principaux: effectuer quelques plongées dans les cavités de l’intérieur de l’île pour mieux connaître les karsts noyés et leur faune associée; prospecter les zones karstiques n’ayant pu être approchées par la mission de reconnaissance du mois d’août, notamment la côte ouest et la pointe nord de l’île; et estimer le potentiel de l’île en habitats anchialins et en faunes associées. Au total, 30 phénomènes karstiques, dont 10 habitats anchialins potentiels, sont repérés; la topographie de la moitié des 2000m de conduits explorés est réalisée; 5 plongées en grottes effectuées. Des collectes de faune souterraine, et plus particulièrement aquatique, sont faites dans la plupart des sites visités.. Des découvertes archéologiques - poteries, ossements humains- s'ajoutent à ces activités. Cette mission, dont les résultats ont complété nos connaissances sur les karsts de l’île et sur la composition de la faune souterraine, a surtout permis d’apporter des informations concrètes nécessaires à l’organisation pratique de SANTO 2006.