Données

Activités

Méthodes
- Relations de parenté
  Méthode cladistique
  Méthodes phénétiques

Mises au point 
  Choix des cractères
- Classifications évolutives
  Vertébrés
  Primates

- Lecture d'un arbre phylogénétique. Notion d'ancêtre commun

- La place des fossiles dans les arbres phylogénétiques

Documentation

Généralités

Phylogène est un logiciel destiné à l'enseignement de l'évolution et de la classification des êtres vivants. Il dispose d'un ensemble de fonctionnalités (observer, comparer, construire, grouper, classer, tracer un arbre) qui permettent de travailler sur des données morphologiques, anatomiques et moléculaires. Il est conçu de façon à permettre d'entrer directement sur les différentes activités en fonction des objectifs : découverte de la biodiversité, classification, établissement de relations de parenté... Il peut donc être utilisé à différents niveaux de la scolarité, de l'école primaire aux premières années universitaires.

Il est indispensable dene pas altérer les dénomination des sous-répertoires et des fichiers et de ne pas les déplacer.

Structure et contenu des dossiers

Le répertoire principal du logiciel comporte 3 dossiers : Aide, Collections, Programmes.

- Le dossier Programmes contient le fichier phylo.exe sur lequel il faut cliquer pour lancer le logiciel.

- Le logiciel démarre en lisant les indications fournies dans le fichier phylini.ini qui figure aussi dans le dossier Programmes. Ce fichier (c'est un simple fichier texte, mais il est recommandé de ne jamais l'altérer sans peser les conséquences...). Il fournit au logiciel des informations indispensables à son fonctionnement : localisation des différentes données, collection par défaut, paramètres spéciaux concernant les arbres phylogénétiques (manipulation non requise au collège), etc. 

- Par défaut, le logiciel démarre avec la collection Vertébrés. Pour changer la collection par défaut, il faut modifier phylini.ini.

- Pour changer de collection au cours d'une session de travail : Choisir Sélectionner une autre collection. Ce choix préalable est absolument est indispensable.

Plusieurs fichiers de taxons sont actuellemnt disponibles. On y accède à partir du menu principal du logiciel (Fichier, puis Ouvrir, puis Fichier d'images).

Des fonctions du logiciel, initialement grisées, deviennent actives.