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Présentation

Données

Activités

Méthodes
- Relations de parenté
  Méthode cladistique
  Méthodes phénétiques

Mises au point 
  Choix des cractères
- Classifications évolutives
  Vertébrés
  Primates

- Lecture d'un arbre phylogénétique. Notion d'ancêtre commun

- La place des fossiles dans les arbres phylogénétiques

Documentation

Pour certains ensembles de taxons, un certaine nombre de données moléculaires sont disponibles. Ces données sont des séquences nucléiques ou protéiques déjà alignées. 

Le tableau ci-dessous présente les données disponibles actuellement pour chacun des fichiers d'images : 

Remarques

• Les molécules ne sont pas forcément disponibles pour tous les taxons du fichier, et les séquences fournies ne sont donc pas forcément celles des taxons effectivement présents dans les fichiers, mais d'animaux appartenant aux mêmes groupes.

• Il est possible d'ajouter des données à un tableau de séquences existant, ou de constituer un nouveau tableau de séquences. Toutes les séquences doivent être alignées. Le logiciel Phylogène lance l'exécutable clustalw.exe qui aligne les séquences. Attention : le temps d'exécution est fonction du nombre et de la longueur des séquences. Le résultat obtenu peut être enregistré.

• Phylogène reconnaît les alignements produits par ailleurs avec clustalw (fichiers avec extension .aln).