Phylogène - Documentation
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    - Relations de parenté
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    Mises au point 
      Choix des cractères
    - Classifications évolutives
      Vertébrés
      Primates

    - Lecture d'un arbre phylogénétique. Notion d'ancêtre commun

    - La place des fossiles dans les arbres phylogénétiques

    Documentation

    Tracer un arbre
    Tracer un arbre phylogénétique
    Le cladogramme ne peut se construire qu'à partir d'une matrice taxons/caractères. Tracé d'un cladogramme pas à pas
     
    La seule hypothèse de départ est que tous les taxons choisis ont une origine commune (un même ancêtre commun)
    Lorsque l'on choisit un caractère, un code couleur apparaît :
    • en jaune: état dérivé du caractère
    • en bleu : état primitif du caractère
    Déplacement des branches de l'arbre:
    • cliquer sur la branche à déplacer avec le bouton gauche de la souris
    • sans lâcher ce bouton, déplacer la souris de façon à venir faire le branchement là où on le souhaite (lorsque le branchement est possible, un symbole apparaît : doigt pointé vers le haut pour un branchement simple ; symbole de multifurcation pour un branchemnt multiple)
    Icônes
     
    Annule les opérations réalisées (une par une)
    Zoom avant. 
    Zoom arrière.
    Affichage des légendes sur chaque branche (état du caractère), sous forme de texte par défaut ; pour un affichage des légendes sous forme numérique (codage : 0 pour l'état primitif,...), cliquer avec le bouton droit de la souris sur l'icône "L", puis choisir l'option souhaitée.
    Cette touche doit être enfoncée pour permettre le travail de permutation des branches et d'affichage du code couleur.
    Enracinement: cliquer sur cette icône, puis se placer sur une branche (ou sur un noeud) et cliquer à nouveau; la figure est alors enracinée sur le taxon choisi.
    Permutation des branches autour d'un noeud: cliquer sur cette icône, puis se placer au niveau d'un noeud et cliquer à nouveau.
    Annule toutes les opérations - retour au point de départ (origine commune à tous les taxons).