Le phénotype xerodermique
Xeroderma 
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Mise à jour : 23/10/2001

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Histoire

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Démarche proposée par J-Y. Dupont, IA-IPR, Orléans-Tours



Facteurs de l'environnement et cellules 

Quels sont les effets du rayonnement ultra-violet sur les cellules de la peau ?
 
Notions mises en place
La peau est l'organe le plus étendu du corps. Sa surface est le lieu privilégié d'échanges entre le milieu extérieur et l'organisme humain. Son rôle est de protéger l'organisme contre les agressions extérieures par des agents physiques ou chimiques.

Parmi les rayons ultra-violets du rayonnement solaire les UV-C, de haute énergie, sont normalement filtrés par la couche d'ozone et atteignent très faiblement la peau. Les UV-B, qui constituent environ 5% des ultraviolets parvenant à la surface de la terre, pénètrent dans la peau et lèsent les cellules de l'épiderme. Les UV-A (95% des UV du spectre solaire terrestre) pénètrent très profondément dans la peau jusqu'au derme. L'agression de la peau par les UV peut induire des tumeurs cutanées par atteinte de leur ADN. 

Quels sont les effets des UV sur l'ADN ? 
 
Ressources
Activités envisageables
Coordonnées tridimensionnelles d'une protéine de réparation (endonucléase du phage T4) sur un fragment d'ADN altéré par les UV Visualisation 3D d'une portion d'ADN altéré par les UV.

Visualisation 3D de cette protéine en position sur l’ADN au niveau de la zone altérée. 
 

Conclusions

  • Les UV altèrent l'ADN des cellules en modifiant sa structure spatiale.
  • Le plus souvent, chez la plupart des individus, l'ADN est cependant réparé par l'intervention de protéines réparatrices.
  • Chez quelques individus, atteints d'une maladie rare, le Xeroderma pigmentosum, l'ADN n'est pas réparé. 
Le phénotype peut se définir à plusieurs niveaux et dépend de protéines

Comment cette maladie se manifeste-t-elle ?
 
Ressources
Activités envisageables
Séquences de protéines intervenant dans la réparation de l'ADN (individus normaux et xerodermiques) Exploitation d’un document extrait et traduit de "Understanding Xeroderma Pigmentosum".

Des documents en macroscopie.

Comparaison de la capacité de réparation de l'ADN chez des cellules de peau d'un individu sain et d'un individu xérodermique.

Comparaison des séquences de protéines intervenant dans la réparation de l'ADN chez un individu normal et des individus atteints de Xeroderma. 

Conclusions

  • Le phénotype peut se définir à différentes échelles, macroscopique, cellulaire, moléculaire.
  • Les phénotypes alternatifs sont dûs à des différences dans les protéines concernées.
Les propriétés des protéines dépendent de leurs séquences respectives en acides aminés 

Pourquoi les protéines réparatrices sont-elles efficaces chez la plupart des individus et peu (ou pas) efficaces chez les individus xérodermiques ?
 
Ressources
Acivités envisageables
Séquences de protéines intervenant dans la réparation de l'ADN (individus normaux et xerodermiques). Un prolongement de l'exploitation de l'activité précédente peut conduire à ces notions. 

Comparaison des séquences de protéines intervenant dans la réparation de l'ADN chez un individu normal et des  individus atteints de Xeroderma. 

Conclusions

  • Les propriétés des protéines dépendent de leurs séquences respectives en acides aminés. 
  • Les enzymes...des changements dans la séquence des acides aminés... modifient leur activité.
  • Ces protéines, en régissant la structure et les activités des cellules, contribuent à l’établissement du phénotype.
  • L'activité des enzymes contribue à la réalisation du phénotype. 
Les protéines sont le produit de l'expression des gènes

Quelle relation y-a-t-il entre gène et protéine produite dans la cellule ?
 
Ressources
Activités envisageables
Séquences des allèles gouvernant la synthèse des protéines xpc, xpf,... Sachant que l’information génétique déterminant la protéine xpc est localisée sur le chromosome 3, on cherche à comprendre la correspondance entre gène et protéine. 

Comparaison  entre elles des séquences du gène issu du chromosome 3 d’individus sains et malades. Mise en relation avec les séquences protéiques correspondantes (position des différences éventuelles dans la protéine et le gène). 

Conclusions

  • Les gènes sont des segments de la molécules d’ADN codant pour des protéines. La séquence des nucléotides dans l’ADN gouverne la séquence des acides aminés dans la protéine selon un système de correspondance : le code génétique.
  • La séquence des acides aminés des protéines est imposée par l'information génétique  située dans la molécule d'ADN...
Les relations entre les allèles d'un même gène (dominance/récessivité)

Quels génotypes peuvent expliquer les phénotypes observables chez les individus atteints de Xeroderma ?
 
Ressources
Activités envisageables
Génotypes (par rapport au gène xpc) des membres des familles 1,2,3. Déterminer les génotypes de plusieurs individus ayant le même phénotype clinique. Comprendre pourquoi dans une famille un enfant peut-être atteint.

Conclusions

  • Au niveau du phénotype clinique, un individu hétérozygote pour un gène Xp (allèle normal/allèle muté) a le même phénotype qu'un individu homozygote pour l'allèle normal. On peut donc considérer que ce dernier est dominant sur les allèles mutés.
  • Un même phénotype macroscopique peut correspondre à plusieurs génotypes. 
Un phénotype macroscopique donné résulte de processus biologiques gouvernés par l'expression de plusieurs gènes - Un même phénotype macroscopique peut donc correspondre à plusieurs génotypes
 
Ressources
Activités envisageables
Génotypes d'individus sains (par rapport aux gènes xpa à xpg)
et d'individus malades.
Le mécanisme de réparation de l’ADN : la réparation de l'ADN est un processus biologique faisant intervenir plusieurs protéines résultant de l'expression de plusieurs gènes :  Comparaison des génotypes (séquences des gènes) présents chez divers individus malades avec ceux d’un individu sain. 

Comparaison des génotypes de divers individus sains entre eux et avec leur descendance (Anagène). 

Conclusions

  • Un phénotype macroscopique donné résulte de processus biologiques gouvernés par l’expression de plusieurs gènes.
  • La mutation de l’un seulement de ces gènes peut altérer ce phénotype. Un même phénotype macroscopique peut correspondre
  • à plusieurs génotypes.

 
Influence de l'environnement sur le phénotype

Y-a-t-il des conditions à la réalisation du phénotype macroscopique ?
 
Ressources
Activités envisageables
Texte à analyser. Exploitation d’un texte "Tips for protecting children" de même origine que le texte initial et qui explique les mesures à prendre dans la vie quotidienne pour un enfant atteint de Xeroderma. 

Conclusions
 

  • La réalisation d’un phénotype macroscopique dépend de l’interaction de plusieurs gènes entre eux et avec des facteurs de l’environnement.
Aller plus loin


Médecine prédictive et diagnostic prénatal

Peut-on diagnostiquer le XP ?
 
Ressources
Activités envisageables
Texte à analyser. Exploitation d'un texte (Mise au point : le xerodema pigmentosum ; A. Stary et A. Sarasin dans La Presse Médicale N° 40 Décembre 1997)

Médecine prédictive et diagnostic prénatal ont pour but de détecter la présence de certains allèles chez un individu (ES, L)
 

Des essais de thérapie génique

Va-t-on vers un traitement du XP ?
 
Notions mises en place
Activités envisageables
Des perspectives de traitement par thérapie génique. Exploitation d'un texte : Les recherches en cours sur l’introduction de gènes corrects dans des kératinocytes in vitro ouvrent des perspectives de thérapie génique.


Institut national de recherche pédagogique