Séquences pour Phylogène
Covid-19 - Ressources moléculaires
Le séquençage a montré seulement 79% d’identité nucléotidique avec le SARS-CoV et 50 % avec le MERS-CoV, 96 % d’identité avec celui d’un virus de chauve-souris (Bat CoV RaTG13) et 99% d’identité avec le génome d’un coronavirus détecté chez le pangolin. (Extrait ANSES)
Séquences pour Phylogène
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Origine NCBI. Alignement avec Clustalx/ClustalOmega Séquences nucléiques alignées des coronavirus Sars-CoV-1, Sars-CoV-2 et MERS chez l'homme, ainsi que de la chauve-souris RaTG13 et du pangolin. Génomes complets. Coronavirus-humains-HCoV-bis.aln Séquences nucléiques alignées de 7 coronavirus humains. Génomes complets. Coronavirus animaux et humains Séquences nucléiques de 15 coronavirus connus. Génomes complets. Domaine de fixation au récepteur ACE.aln Domaine de fixation au récepteur ACE2 pour Sars-CoV2, Sars-CoV1, RaTG13 et Pangolin. |
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Phylogénie des séquences de Sars-CoV-2 sur Nextstrain. Séquences de GISAID. |
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