Recherche de l'histoire évolutive des gènes HLA de classe I
Recherche de l'histoire évolutive des gènes HLA de classe I
L'objectif de cette étude est de faire prendre conscience que les allèles présents dans les populations humaines sont l'aboutissement actuel des mutations survenues dans le passé.
Les séquences relatives à la spécificité HLA B27sont propices pour approcher ce problème.
A partir des informations fournies dans les pages précédentes sur les fréquences des différents allèles HLAB27, on doit choisir HLA B2705 comme référence (allèle le plus fréquent, présent avant la diversification des populations humaines).
Il reste à travailler sur ces constats pour regrouper les allèles les plus étroitement apparentés et proposer un schéma de filiation entre ces différents allèles.
Filiation possible entre les différents allèles de HLA B27
On peut ensuite faire prendre conscience des limites des modalités précédentes (apparition des allèles par mutations à partir de l'allèle ancestral unique) pour expliquer l'étendue des différences entre les allèles HLA A1 et HLA A2 et proposer l'hypothèse trans-spécifique de Klein. On peut ainsi demander aux élèves de comparer l'allèle CHLA A108 du Chimpanzé avec les allèles HLA A humains et d'indiquer en quoi les informations tirées de cette comparaison corroborent l'hypothèse trans-spécifique.
| HLA A0101 | 0 | ||||
| HLA A0201 | 50 | 0 | |||
| HLA A1101 | 12 | 50 | 0 | ||
| HLA A2401 | 47 | 49 | 48 | 0 | |
| CHLA A108 | 24 | 48 | 15 | 53 | 0 |
| HLA A0101 | HLA A0201 | HLA A1101 | HLA A2401 | CHLA A108 |
Matrice des différences entre des allèles HLA A et l'allèle CHLA A108 du Chimpanzé.