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Modélisation des réactions immunitaires

Activité NetBioDyn

Livret du stage

En immunologie, l’utilisation de modèles numériques conçus avec le logiciel NetBioDyn (outil de modélisation multi-agents développé par Pascal Ballet à l’Université de Bretagne Occidentale, Brest) est particulièrement intéressante lorsqu’il s’agit de travailler autour d’expériences réellement menées par les immunologistes mais non réalisables en classe. Les activités proposées avec NetBiodyn peuvent servir à la construction de différentes notions dans la partie « Le maintien de l’intégrité de l’organisme : quelques aspects de la réaction immunitaire » du programme de la classe de Terminale S, en particulier sur des points pour lesquels on a recours habituellement à l’exploitation de documents. Premier temps : prise en main du logiciel NetBioDyn à l’aide de modèles déjà construits. Au cours de ce premier temps, on exploite différents modèles numériques qui sont chacun associés à une expérience de référence ayant permis de construire le modèle. C’est l’occasion de prendre en main les différentes fonctionnalités du logiciel en mode « simulation », tout en envisageant les différentes notions du programme déduites de l’utilisation des modèles. Les modèles numériques utilisés lors de ce premier temps concernent une thématique du nouveau programme de Terminale S : La réaction inflammatoire, un exemple de réponse innée. Deuxième temps : initiation à la construction d’un modèle numérique avec NetBioDyn. Au cours de ce deuxième temps, on se place en situation de construire un modèle. Une expérience référente est analysée et on se focalise sur la confection du modèle numérique correspondant : édition des entités, mise en équation des comportements. C’est l’occasion de prendre en main les différentes fonctionnalités du logiciel en mode « création de modèle ». On se placera dans le cadre d’une autre thématique du programme : Le phénotype immunitaire au cours de la vie, avec la notion de mémoire immunitaire.