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Les fluorochromes

Par pothet — Dernière modification 18/09/2015 14:50

Tableau des fluorochromes

Voici un tableau de quelques caractéristiques de fluorochromes utilisés en cytométrie en flux ou en microscopie à fluorescence.

 

fluorochrome Ex (nm) Em (nm) MW Notes
Fluorophores conjugués
Hydroxycoumarine 325 386 331 Succinimidyl ester
Aminocoumarine 350 445 330 Succinimidyl ester
Méthoxycoumarine 360 410 317 Succinimidyl ester
Bleu cascade 375;400 423 596 Hydrazide
Jaune lucifer 425 528    
NBD 466 539 294 NBD-X
R-Phycoérythrine (PE) 480;565 578 240 k  
PE-Cy5 conjugués 480;565;650 670   aka Cychrome, R670, Tri-Color, Quantum Red
PE-Cy7 conjugués 480;565;743 767    
APC-Cy7 conjugués 650;755 767   PharRed
Red 613 480;565 613   PE-Texas Red
Fluorescéine (FITC) 495 519 389 sensible au pH
FluorX 494 520   587  
BODIPY-FL 503 512    
TRITC 547 572 444 TRITC
X-Rhodamine 570 576 548 XRITC
Lissamine Rhodamine B 570 590    
PerCP 490 675   Peridinin chlorphyll protein
Texas Red 589 615 625 Sulfonyl chloride
Allophycocyanine (APC) 650 660 104 k  
TruRed 490,675 695   PerCP-Cy5.5 conjugués
Alexa Fluor 350 346 445   410  
Alexa Fluor 430 430 545   701  
Alexa Fluor 488 494 517   643  
Alexa Fluor 532 530 555   724  
Alexa Fluor 546 556 573   1079  
Alexa Fluor 555 556 573   1250  
Alexa Fluor 568 578 603   792  
Alexa Fluor 594 590 617   820  
Alexa Fluor 633 621 639   1200  
Alexa Fluor 647 650 668   1250  
Alexa Fluor 660 663 690   1100  
Alexa Fluor 680 679 702   1150  
Alexa Fluor 700 696 719    
Alexa Fluor 750 752 779    
Cy2 489 506   714  
Cy3 (512);550 570;(615)   767  
Cy3.5 581 596;(640)   1102  
Cy5 (625);650 670   792  
Cy5.5 675 694   1128  
Cy7 743 767   818  
Marqueurs des acides nucléiques
Hoechst 33342 343 483  616  AT-selective
DAPI 345 455    AT-selective
Hoechst 33258 345 478  624  AT-selective
SYTOX Blue 431 480  ~400  ADN
Chromomycine A3 445 575    CG-selective
Mithramycine 445 575    
YOYO-1 491 509   1271  
SYTOX Green 504 523  ~600  ADN
SYTOX Orange 547 570  ~500  ADN
Ethidium Bromide 493 620  394  
7-AAD 546 647    7-aminoactinomycine D, CG-selective
Acridine Orange 503 530/640   ADN/ARN
TOTO-1, TO-PRO-1 509 533   Coloration vitale, TOTO: Cyanine Dimère
TO-PRO: Cyanine Monomère
Thiazole Orange 510 530    
Propidium Iodide (PI) 536 617 668.4  
TOTO-3, TO-PRO-3 642 661    
LDS 751 543;590 712;607 472 ADN (543ex/712em), ARN (590ex/607em)
Marqueurs de fonctions cellulaires
Indo-1 361/330 490/405 1010 AM ester. Valeurs faible/fortes de Ca++,
Fluo-3 506 526 855 AM ester. pH > 6
DCFH 505 535 529 2'7'Dichorodihydrofluorescéine, forme oxydée
DHR 505 534 346 Dihydrorhodamine 123,  forme oxydée,
oxydation catalysée par la lumière
SNARF 548/579 587/635   pH 6/9
Protéines fluorescentes
Y66F 360 508    
Y66H 360 442    
EBFP 380 440    Quantum yield 0.18
Wild Type 396,475 508,503    
GFPuv 385 508    
ECFP 434 477    Quantum yield 0.40
Y66W 436 485    
S65A 471 504    
S65C 479 507    
S65L 484 510    
S65T 488 511    
EGFP 489 508    Quantum yield 0.60
EYFP 514 527    Quantum yield 0.61
DsRed 558 583    Quantum yield 0.29
Autres marqueurs
Monochlorobimane 380 461 226 Glutathione probe
Calcein 496 517 623 pH > 5

Legende :

  • Ex: longueur d'onde du pic d'excitation (nm)
  • Em: longueur d'onde du pic d'émission (nm)
  • MW: masse molaire

Traduit de Salk Flow Cytometry home page