Approche anatomique, approche moléculaire
Continuité entre approches anatomique et moléculaire des phylogénies
L'utilisation des données moléculaires devrait permettre de conforter les phylogénies obtenues avec les données anatomiques, d'en affiner certaines, et d'aborder les relations de parenté dans les cas où les données anatomiques ne sont pas disponibles ou adaptées.
Un texte de cadrage présentera quelques propositions d'intégration pédagogique.
1 - Une nouvelle collection "Unité du vivant Lycée" adaptée au lycée est proposée (en plus des collections vertébrés actuels et fossiles du collège et de la collection Vertébrés seconde). Cette collection est calée sur la liste des organismes dont on dispose des séquences de la molécule "CDC2" (Contrôle du cycle de la division cellulaire). Le gène CDC2 code pour une protéine-kinase qui exerce un contrôle sur deux points crutiaux du cycle cellulaire : l'entrée en phase S, et l'entrée en mitose.
A l'échelle du vivant ou presque (nous ne disposons malheureusement pas du CDC2 d'une Bactérie), il est donc possible d'étudier les relations de parenté sur des bases anatomiques et moléculaires avec les mêmes organismes.
Unité du vivant - Données anatomique
Séquences CDC2
2 - De nouveaux jeux de données moléculaires sont également fournis pour l'étude des phylogénies entre Primates (Molécules retenues : ADN mitochondrial de la cytochrome oxidase subunité 1 (COI utilisée pour le barcoding) ; Protéine de la cytochrome C oxydase 2 (COX2) ; Chaîne de la globine bêta (HBB).
Primates – Données anatomiques
Séquences globine bêta
Séquences opsine-bleu
Séquences COX2
Séquences COI primates
Séquences COI Hominoïdes
3 - Pour les Vertébrés,les fichiers de séquences sont calés sur la liste des taxons de la collection Vertébrés seconde. Molécules retenues : HBA-Vertebres ; HBB-Vertebres ; ARN 12S-Vertebres ; Cytochrome B oxydase (Cytb-Vertebres). Deux fichiers plus fournis en staxons (ARN 12S-Vertebres-Etendu ; HBA-Verrtebres-Etendu ; HBB-Vertebres-Etendu) permettent d'effectuer d'autres échantillonnages.
Vertébrés seconde - – Données anatomiques
Séquences globine alpha
Séquences globine bêta
Séquences ARN 12S
Séquences cytochrome B oxydase
