 Le logiciel Phylogène
Généralités
Phylogène est un logiciel destiné à l'enseignement de l'évolution et de la classification des êtres vivants. Il dispose d'un ensemble de fonctionnalités (observer, comparer, construire, classer, polariser des caractères, établir des parentés, dater) qui permettent de travailler sur des données morphologiques, anatomiques et moléculaires. Il est conçu de façon à permettre d'entrer directement sur les différentes activités en fonction des objectifs : découverte de la biodiversité, classification, établissement de relations de parenté... Il peut donc être utilisé à différents niveaux de la scolarité, de l'école primaire aux premières années universitaires.
Il est indispensable de ne pas altérer les dénomination des sous-répertoires et des fichiers et de ne pas les déplacer.
Structure et contenu des dossiers
Le répertoire principal du logiciel comporte 4 dossiers : Aide, Collections, Programmes et configurations.
- Le dossier "Programmes" contient le fichier phylo.exe sur lequel il faut cliquer pour lancer le logiciel.
- Le logiciel démarre en lisant les indications fournies dans le fichier phylini.ini qui figure dans le dossier Programmes. Ce fichier (c'est un simple fichier texte, mais il est recommandé de ne jamais l'altérer sans peser les conséquences...). Il fournit au logiciel des informations indispensables à son fonctionnement : localisation des différentes données, collection par défaut, paramètres spéciaux concernant les arbres phylogénétiques (manipulation non requise au collège) et un paramétrage ModeCollege=non (pour le lycée) ou ModeCollege=oui pour le collège.
Le paramètre ModeCollege du fichier Phylini est (en dehors des collections) la seule différence entre la version collège et la version lycée. Si l'établissement comporte des classes de collège et de lycée, installer la version lycée (ou configurer le fichier Phylini.ini avec ModeCollege=non). Les collections collège, et certaines collections du lycée destinées aux classes de seconde, ont un fichier de configuration qui force le mode collège. Par contre si le fichier Phylini.ini comporte Modecollege=oui, toutes les collections seront ouvertes en mode collège.
- Le dossier "collections"contient les différentes collections.
- Le dossier "configurations" contiendra les différentes configurations sauvegardées.
Celles-ci peuvent être placées dans un autre répertoire, sur la même machine ou sur un réseau sans que cela porte à conséquence si la machine sur laquelle on travaille utilise un Phylogène ayant les mêmes collections.
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