Comparaison des logiciels Anagène et GénieGen
Par jfmadre
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Dernière modification
27/12/2020 11:00
GénieGen apporte quelques améliorations à l'affichage et à certains traitements des données et permet une représentation graphique des séquences.
Anagène reste indispensable pour la richesse de sa base de données et de sa documentation, issues des travaux innovants de plusieurs équipes d'ACCES.
Les points forts de chaque logiciel
| Anagène |
GénieGen |
- Une banque de séquences très fournie, classée par thèmes et par niveaux, et mise à jour pour les nouveaux programmes.
- Une documentation détaillée expliquant l'intérêt pédagogique de l'utilisation des séquences de la banque de données.
- De nombreux exemples d'utilisation sur les sites académiques.
- Un outil Dot Plot pour repérer les exons et les introns en comparant gène et ARNm.
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- Des résultats d'alignement avec un tableau de comparaison des séquences alignées où l'on peut choisir le type de résultat affiché (ressemblance ou différence, nombre ou pourcentage...).
- Un outil de représentation graphique des séquences étudiées.
- La possibilité de copier des "morceaux choisis" des séquences (par exemple les zones qui sont différentes) pour coller dans un compte-rendu.
- Possibilité d'éditer de manière simple une séquence pour simuler une mutation, en indiquant le type de mutation et la position dans la séquence.
- Une compatibilité avec les formats de fichiers des banques de données internationales (fasta...) et aussi avec les fichiers d'Anagène. Possibilité d'utiliser un fichier .pdb (données moléculaires 3d) comme fichier de séquence.
- La possibilité de traiter des séquences circulaires.
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