Comparaisons

La comparaison de molécules peut être réalisée de différentes manières.

Différentes molécules chacune dans une fenêtre

C'est le moyen le plus simple si on dispose de différentes molécules à comparer.

Ouvrir plusieurs fenêtres avec Fichier, Nouveau, ou avec l'icône .

Réorganiser les fenêtres avec l'icône 

Cliquer dans une fenêtre pour la rendre active. Le bandeau supérieur de la fenêtre devient bleu.

Charger un fichier de molécule dans chaque fenêtre.

Chacune des molécules se manipule indépendamment des autres.
Exemple : molécules de la douleur
Exemple : ADN humain
Exemple : ADN et ARN
Exemple : universalité de l'ADN

Une même molécule dans des fenêtres différentes

Si on souhaite obtenir différentes visualisations ou des détails de la même molécule, on peut ouvrir cette molécule à plusieurs reprises, dans des fenêtres différentes.
Exemple : ADN
Exemple : Structure d'un nonapeptide
 

Si on souhaite repérer les conséquences des mutations sur la structure d'une molécule, on peut ouvrir cette molécule à plusieurs reprises, dans différentes fenêtres, l'une servant de référence, les autres servant au repérage des mutations (on peut utiliser des scripts).
Exemple : Phénylalanine hydroxylase
 
 

Plusieurs molécules dans une même fenêtre

- Molécules juxtaposées

Fichier, Ouvrir une première molécule.
Cliquer sur la molécule avec le bouton droit de la souris, et la déplacer sur l'écran.
Fichier, Ajouter, une deuxième molécule.

Activer le bouton Univers  pour manipuler les molécules conjointement ou le désactiver  pour les manipuler séparément.séparément.

Avec l'Univers désactivé, on sélectionne la molécule active avec l'icône .
Lire le nom de la molécule active dans le panneau de commande.
Exemple :   Nucléotides
Exemple :   Structure de l'ADN
Exemple :   Acides aminés
Exemple :   Enchaînement des acides aminés
Exemples : Famille multigénique des globines ;

Globines des Vertébrés

- Molécules superposées

Fichier, Ouvrir une première molécule.
Fichier, Ajouter, une deuxième molécule.
Le centre de rotation des deux molécules est le centre de l'univers.

Activer le bouton Univers  pour manipuler les molécules conjointement ou le désactiver  pour les manipuler séparément.

Avec l'Univers désactivé, on sélectionne la molécule active avec l'icône .
Lire le nom de la molécule active dans le panneau de commande.

Exemple : globines bêta normale et drépanocytaire 
Exemple : globines humaines alpha et bêta 
Exemple : globines humaines alpha, bêta, gamma zêta
Exemple : myoglobines de Vertébrés (Cheval, Cachalot, Tortue, Requin) 
Exemple : enzyme (carboxypeptidase avec ou sans substrat) ;

Enzyme (carboxypeptidase : site catalytique avec ou sans substrat)