Aller au contenu. | Aller à la navigation

Outils personnels

Plateforme - ACCES
Navigation
Vous êtes ici : Accueil / Thématiques / Génétique moléculaire et évolution / Dossiers thématiques / Covid-19 / Contenu des fichiers pour Phylogène

Contenu des fichiers pour Phylogène

Par Naoum Salamé Dernière modification 05/03/2024 09:42

 Fichiers disponibles

Origine NCBI.

Alignement avec Clustalx/ClustalOmega

Séquences nucléiques alignées des coronavirus séquencés chez 10 Chinois de Wuhan.

Sars-CoV-2-Wuhan.aln

Résultats

Matrice des distances


Séquences nucléiques alignées des coronavirus séquencés chez 10 citoyens de différents états des USA. Séquences déposées la 1ère semaine d'avril 2020.

Sars-CoV-2-USA.aln


Séquences nucléiques alignées des coronavirus Sars-CoV-1, Sars-CoV-2 et MERS chez l'homme, ainsi que de la chauve-souris RaTG13 et du pangolin. Génomes complets.

Sars-Cov-2.aln

Résultats

Arbres et matrices des distances.

Séquences nucléiques alignées de divers coronavirus humains. Génomes complets.

Coronavirus humains (HCov)-bis.aln

Résultats

Arbres et matrice des distances


Séquences nucléiques de 15 coronavirus animaux et humains. Génomes complets.

Coronavirus animaux et humains.aln

Résultats

Arbres et matrices des distances.

Domaine de fixation au récepteur ACE2 pour Sars-CoV-2, Sars-CoV-1, RaTG13 et Pangolin.

Domaine de fixation au récepteur ACE.aln

Résultats

Matrice des distances