Sirius
Par salame
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Dernière modification
29/09/2017 13:36
Sirius est un logiciel de visualisation spatiale des molécules réalisé par le San Diego Super Computer (Université de Californie à San Diego).
La version est en anglais et à télécharger ici
Présentation rapide des spécificités de Sirius
Ecran d'accueil
Remarquer la possibilité d'affichage simultané de la séquence en 3D, de sa structure et de sa composition atomique. La barre des icônes est paramétrable (nature des icône et emplacement de la barre dans la fenêtre, ici calée en haut).
Principales caractéristiques du logiciel
Par rapport à Rasmol et Rastop, Sirius présente plusieurs innovations :
- Language de commande et scripts compatibles avec RasMol (et RasTop)
- Accès direct aux banques de données en ligne PDB, InterPro et Uniprot
- Alignement des structures protéiques relatives aux molécules affichées
- Editeur évolué des alignements de séquences
- Modélisation de structures protéiques à partir de fragments et de peptides
- Ajout des hydrogènes, détection des liaisons hydrogène et des conflits stériques
- Affichage des éléments d'une structure couplé avec la visualisation 3D
- Sélection graphique des élèments couplée avec le choix des modes de visualisation et de la coloration
- Manipulation indépendante des différentes structures affichées