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Les données moléculaires

Par apothet — Dernière modification 29/09/2017 13:37

 

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Pour certains ensembles de taxons, des données moléculaires sont disponibles. Ces données sont des séquences nucléiques ou protéiques déjà alignées. 

Remarques

  • Les molécules ne sont pas forcément disponibles pour tous les taxons du fichier, et les séquences fournies ne sont donc pas forcément celles des taxons effectivement présents dans les fichiers, mais d'animaux appartenant aux mêmes groupes.
  • Il est possible d'ajouter des données à un tableau de séquences existant, ou de constituer un nouveau tableau de séquences. Toutes les séquences doivent être alignées. Le logiciel Phylogène lance l'exécutable clustalw.exe qui aligne les séquences. Attention : le temps d'exécution est fonction du nombre et de la longueur des séquences. Le résultat obtenu peut être enregistré.
  • Phylogène reconnaît les alignements produits par ailleurs avec clustalw (fichiers avec extension .aln).