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du côté des élèves -pigments rétiniens et parentés entre espèces - Possibilité 2

Une variante intégrant l'utilisation de Phylogène.

Au moment d'exploiter les comparaisons moléculaires (séquences protéiques des opsines de différentes espèces), l'utilisation de Phylogène est une alternative pouvant représenter d'une part un gain de temps, d'autre part une aide à la conceptulaisation des relations de parenté.

  • Une matrice des distances hébergée dans les fichiers moléculaires de Phylogène  (collection Archontes (Primates) - Fichier/ ouvrir/ Tableau de séquences/ opsines-bleu-Primates.aln) :

matrice_distances_opsineS_Primates

 [capture écran logiciel Phylogène : matrice exprimant les pourcentages de différences entre les séquences  d'acides aminés de l'opsine S des différents primates]

 

  • L' "arbre" (au sens strict du terme, il s'agit d'un phénogramme) représentant les relations de parenté entre espèces, déduites de la matrice des distances :

phénogramme_opsine_S_Primates

[capture écran logiciel Phylogène : phénogramme Primates (opsine S, méthode UPGMA)]


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