Matrice des distances obtenue après comparaison des séquences protéiques par alignement avec discontinuité (logiciel Anagène)
Homo sapiens
Bos taurus
Gallus gallus
Cricetulus longicaudatus
Rattus norvegicus
Mus musculus
Homo sapiens
0
Bos taurus
94 %
0
Gallus gallus
75 %
75 %
0
Cricetulus longicaudatus
88 %
82 %
66 %
0
Rattus norvegicus
90 %
87 %
73 %
94 %
0
Mus musculus
91%
88 %
74 %
95 %
96 %
0
Exploitation des données de la matrice
Raisonnement :
- Lorsque les similitudes des séquences sont trop importantes, ce n'est pas le fruit du hasard mais le témoignage d'une parenté: ces molécules sont des molécules homologues qui proviennent d'une molécule ancestrale possédée par l'ancêtre commun aux six espèces étudiées.
- Les espèces les plus étroitement apparentées sont celles qui présentent le plus fort pourcentage de similitudes dans les séquences (méthode phénétique).
Application :
- Les protéines bcl2 des six espèces étudiées sont homologues et les six espèces sont apparentées
- On peut distinguer deux ensembles : d'une part les espèces Homo sapiens et Bos taurus qui sont toutes deux étroitement apparentés, d'autre part les espèces Cricetulus longicaudatus, Rattus norvegicus, Mus musculus qui sont toutes trois étroitement apparentées.
